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frank_zhan

金虫 (正式写手)

[求助] 怎么利用PWSCF计算差分电荷密度

各位亲虫们,
我想计算一个体系的差分电荷密度,但是不知道过程是怎样的?比如我计算一个SWNT上修饰金原子(Au)的团簇。我想计算这两者之间的电荷转移量。理论上是利用SWNT@Au体系的总电荷密度减掉SWNT和Au团簇的电荷密度。
请求虫友们指导个详细的过程,必有重谢!
谢谢。
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frank_zhan,zy2zhan@gmail.com
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cj4566

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by huazhorg at 2012-07-09 12:50:28
先算SWNT@Au的电荷密度,再算SWNT@Au-Au的电荷密度,再算SWNT@Au-SWNT的电荷密度,然后用前者减去后两者。
过程:
scf1.in,->rho1.in->得到ppn1.rho
scf2.in, ->rho2.in得到ppn2.rho
scf3.in, ->r ...

你好,我不太明白最开始的三个文件,是要建三个体系分别做scf计算然后算它们的电荷密度并相减吗?下面两个图是文章上的差分电荷密度图,是不是分别对吸附体系,氧化锌表面和有机分子进行scf计算,然后算它们的电荷密度?如果这样的话,ecut和kpoint都用一样吧,望赐教,谢谢!!!

吸附图



差分电荷密度图

8楼2012-08-23 09:35:23
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查看全部 26 个回答

frank_zhan

金虫 (正式写手)

哪位虫友来回答一下,必有重酬啊。
frank_zhan,zy2zhan@gmail.com
2楼2012-07-09 11:44:23
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huazhorg

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
frank_zhan: 金币+10, 有帮助, 谢谢指导,我先试试,假如可以的话,我会继续给金币的,哈哈。 2012-07-09 14:28:45
uuv2010: 金币+1, 多谢提示 2012-07-11 11:44:59
先算SWNT@Au的电荷密度,再算SWNT@Au-Au的电荷密度,再算SWNT@Au-SWNT的电荷密度,然后用前者减去后两者。
过程:
scf1.in,->rho1.in->得到ppn1.rho
scf2.in, ->rho2.in得到ppn2.rho
scf3.in, ->rho3.in得到ppn3.rho
最后算dif.rho.in:
  /
&plot
    nfile = 3,
    filepp(1) = 'ppn1.fpl',
    filepp(2) = 'ppn2.fpl',
    filepp(3) = 'ppn3.fpl',
    weight(1) = 1.0,
    weight(2) = -1.0,
    weight(3) = -1.0,
    iflag = 3,
    output_format = 5,
    fileout = 'ppn_diff.rho',
/
得到差分密度文件ppn_diff.rho和ppn_diff.xsf,其中ppn_diff.xsf可以用xcrysden画差分电荷密度图。
3楼2012-07-09 12:50:28
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frank_zhan

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by huazhorg at 2012-07-09 12:50:28
先算SWNT@Au的电荷密度,再算SWNT@Au-Au的电荷密度,再算SWNT@Au-SWNT的电荷密度,然后用前者减去后两者。
过程:
scf1.in,->rho1.in->得到ppn1.rho
scf2.in, ->rho2.in得到ppn2.rho
scf3.in, ->r ...

谢谢仁兄的回复。不过我还有一个问题。就是你写的那个scf1.in,->rho1.in->得到ppn1.rho,是表示什么。我知道第一个SCF1是表示对总的体系进行自洽计算,然后rho1.in是什么呢,这个我不太熟啊。能否指导一下。谢谢。
frank_zhan,zy2zhan@gmail.com
4楼2012-07-09 14:37:15
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