应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 做irc后计算反应物、产物、过渡态能量时，是否要加opt命令？
51/1返回列表
查看: 727  |  回复: 2
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

aywater

木虫 (正式写手)

[求助] 做irc后计算反应物、产物、过渡态能量时，是否要加opt命令？

请教一个问题，TS做出的过渡态，做irc后计算反应物、产物、过渡态能量时，是否要加opt命令？
能否直接取irc提取出的反应物和产物的结构，不优化而直接计算能量？
若取没有优化，直接IRC提取出来的结果进行能量和频率计算，发现反应物有个小虚频，-110. 这样的结果不能用吧，是不是反应和产物要进行优化，而过渡态直接提取结构计算能量即可？

[ Last edited by aywater on 2012-7-5 at 17:17 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-07-05 17:15:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aywater

木虫 (正式写手)
我是做丙二腈水解路径分析。一种路径生成胺，这个我已经做出来了。另一种是猜测能生成氰，这个做不出来。所以只有先猜测过渡态，用opt（TS）+freq命令优化找到过渡态，然后再根据推测反应路径。这里有个问题：计算总能量时，反应物的能量是指丙二腈和水的复合体的优化后的总能？还是单独优化丙二腈和水后计算各自能量之和作为反应物的总能？
赞一下 回复此楼
3楼2012-07-09 20:39:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答

chuanan027

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2012-07-06 14:15:46
你是直接先优化的过渡态啊？IRC出来的反应物和产物的话，肯定要优化的。因为我们要的是全优化的结果，IRC出来的只能说是优化不完全的物种。不支持先优化过渡态再IRC来找反应物和产物，一般都是先优化好反应物或（和）产物再来优化过渡态的。你可以看看小卒写的《优化过渡态之前要知道的事》（好像是这个名字）。
赞一下 回复此楼
Timeandtidewaitfornoman.Comeon,baby!
2楼2012-07-06 12:40:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭