24小时热门版块排行榜    

查看: 845  |  回复: 2

aywater

木虫 (正式写手)

[求助] 做irc后计算反应物、产物、过渡态能量时,是否要加opt命令?

请教一个问题,TS做出的过渡态,做irc后计算反应物、产物、过渡态能量时,是否要加opt命令?
能否直接取irc提取出的反应物和产物的结构,不优化而直接计算能量?
若取没有优化,直接IRC提取出来的结果进行能量和频率计算,发现反应物有个小虚频,-110. 这样的结果不能用吧,是不是反应和产物要进行优化,而过渡态直接提取结构计算能量即可?

[ Last edited by aywater on 2012-7-5 at 17:17 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chuanan027

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2012-07-06 14:15:46
你是直接先优化的过渡态啊?IRC出来的反应物和产物的话,肯定要优化的。因为我们要的是全优化的结果,IRC出来的只能说是优化不完全的物种。不支持先优化过渡态再IRC来找反应物和产物,一般都是先优化好反应物或(和)产物再来优化过渡态的。你可以看看小卒写的《优化过渡态之前要知道的事》(好像是这个名字)。
Timeandtidewaitfornoman.Comeon,baby!
2楼2012-07-06 12:40:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aywater

木虫 (正式写手)

我是做丙二腈水解路径分析。一种路径生成胺,这个我已经做出来了。另一种是猜测能生成氰,这个做不出来。所以只有先猜测过渡态,用opt(TS)+freq命令优化找到过渡态,然后再根据推测反应路径。这里有个问题:计算总能量时,反应物的能量是指丙二腈和水的复合体的优化后的总能?还是单独优化丙二腈和水后计算各自能量之和作为反应物的总能?
3楼2012-07-09 20:39:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 aywater 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 11:40 by jCd0dEvKHShX
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 8/400 2026-08-29 11:17 by jCd0dEvKHShX
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +3 349506619 2026-08-28 3/150 2026-08-29 10:49 by 木风9012
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 05:45 by gy1nBQXYQJqL
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +3 德尚中行 2026-08-27 3/150 2026-08-28 15:24 by rongshuxia
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜? 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
信息提示
请填处理意见