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hlwnxfd2011

银虫 (小有名气)

[求助] 请教怎样在NCBI上寻找开放阅读框?

请教一下各位前辈,怎样查找开放阅读框(在NCBI上)?
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ziwen120717

木虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html,这是NCBI上正宗的查找ORF的,你可以用下。
不想写了
13楼2012-11-09 17:03:07
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普通回帖

sk_yb

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
能说清楚点吗,具体找什么样的ORF,某个基因还是某类基因。
2楼2012-07-02 13:47:44
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wzwhq

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
NCBI上直接查ORF不会,但是我一般都是把序列下下来,用DNASTAR进行查找分析的
3楼2012-07-02 13:59:22
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yuzhiming

捐助贵宾 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
最便捷的方法是你根据发表文献说提到的基因LOC号,去找NCBI找基因的ORF。
4楼2012-07-02 14:30:06
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qhuzhl

金虫 (小有名气)

直接google orf finder 把你的序列粘贴进去就行了,软件会列出可能的orf。
5楼2012-07-02 14:37:59
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Marado

金虫 (正式写手)

Dreamer

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-11-09 14:13:16
推荐楼主一个在线分析ORF的网站:
http://www.91bio.com/SMS2/orf_find.html
不仅可以分析ORF,其他的很多东西都可以分析.

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

Look,ifyouhadoneshot,oroneopportunity,toseizeeverythingyoueverwanted,inonemoment.Wouldyoucaptureit,orjustletitslip?
6楼2012-07-02 14:44:27
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hlwnxfd2011

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sk_yb at 2012-07-02 13:47:44
能说清楚点吗,具体找什么样的ORF,某个基因还是某类基因。

谢谢,是我克隆的一个新基因的ORF。请前辈指点一下,不甚感激!呵
7楼2012-07-02 15:47:06
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hlwnxfd2011

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wzwhq at 2012-07-02 13:59:22
NCBI上直接查ORF不会,但是我一般都是把序列下下来,用DNASTAR进行查找分析的

谢谢指点,我去试一下,呵
8楼2012-07-02 15:48:07
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hlwnxfd2011

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by yuzhiming at 2012-07-02 14:30:06
最便捷的方法是你根据发表文献说提到的基因LOC号,去找NCBI找基因的ORF。

好的,谢谢前辈的指点。
9楼2012-07-02 15:48:39
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hlwnxfd2011

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by qhuzhl at 2012-07-02 14:37:59
直接google orf finder 把你的序列粘贴进去就行了,软件会列出可能的orf。

谢谢这位前辈的指点,我去试一下,呵
10楼2012-07-02 15:50:00
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