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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 请教怎样在NCBI上寻找开放阅读框？
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hlwnxfd2011

银虫 (小有名气)

[求助] 请教怎样在NCBI上寻找开放阅读框？

请教一下各位前辈，怎样查找开放阅读框（在NCBI上）？
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1楼 2012-07-02 13:35:13
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

ziwen120717

木虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html，这是NCBI上正宗的查找ORF的，你可以用下。
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不想写了
13楼2012-11-09 17:03:07
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普通回帖

sk_yb

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
能说清楚点吗，具体找什么样的ORF,某个基因还是某类基因。
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2楼2012-07-02 13:47:44
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wzwhq

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
NCBI上直接查ORF不会，但是我一般都是把序列下下来，用DNASTAR进行查找分析的
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3楼2012-07-02 13:59:22
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yuzhiming

捐助贵宾 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
最便捷的方法是你根据发表文献说提到的基因LOC号，去找NCBI找基因的ORF。
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4楼2012-07-02 14:30:06
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qhuzhl

金虫 (小有名气)
直接google orf finder 把你的序列粘贴进去就行了，软件会列出可能的orf。
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5楼2012-07-02 14:37:59
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Marado

金虫 (正式写手)

Dreamer

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-11-09 14:13:16
推荐楼主一个在线分析ORF的网站：
http://www.91bio.com/SMS2/orf_find.html
不仅可以分析ORF，其他的很多东西都可以分析.
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hlwnxfd2011
Look,ifyouhadoneshot,oroneopportunity,toseizeeverythingyoueverwanted,inonemoment.Wouldyoucaptureit,orjustletitslip?
6楼2012-07-02 14:44:27
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hlwnxfd2011

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by sk_yb at 2012-07-02 13:47:44
能说清楚点吗，具体找什么样的ORF,某个基因还是某类基因。

谢谢，是我克隆的一个新基因的ORF。请前辈指点一下，不甚感激！呵
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7楼2012-07-02 15:47:06
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hlwnxfd2011

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wzwhq at 2012-07-02 13:59:22
NCBI上直接查ORF不会，但是我一般都是把序列下下来，用DNASTAR进行查找分析的

谢谢指点，我去试一下，呵
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8楼2012-07-02 15:48:07
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hlwnxfd2011

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by yuzhiming at 2012-07-02 14:30:06
最便捷的方法是你根据发表文献说提到的基因LOC号，去找NCBI找基因的ORF。

好的，谢谢前辈的指点。
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9楼2012-07-02 15:48:39
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hlwnxfd2011

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by qhuzhl at 2012-07-02 14:37:59
直接google orf finder 把你的序列粘贴进去就行了，软件会列出可能的orf。

谢谢这位前辈的指点，我去试一下，呵
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10楼2012-07-02 15:50:00
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