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Amber做小分子初始结构生成
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各位大侠: 我做一个疏水性表面结构,用packmol生成了一个包含两种物质(a和b)的box.pdb, a和b的参数文件a.frcmod和b.frcmod 以及结构文件a.prep 和b.prep 都正确, 我分布用a和b分别生成amber的拓扑和坐标文件prmtop 和inpcrd都没有问题,但是当我分别load参数和结构后,生成一个包含两种物质的一个统一的拓扑和坐标文件,就是报错,哪位大侠能帮助小弟一下,不胜感激! |
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