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gaussian08

银虫 (小有名气)

[求助] Amber做小分子初始结构生成

各位大侠：
我做一个疏水性表面结构，用packmol生成了一个包含两种物质（a和b）的box.pdb，
a和b的参数文件a.frcmod和b.frcmod 以及结构文件a.prep 和b.prep 都正确，
我分布用a和b分别生成amber的拓扑和坐标文件prmtop 和inpcrd都没有问题，但是当我分别load参数和结构后，生成一个包含两种物质的一个统一的拓扑和坐标文件，就是报错，哪位大侠能帮助小弟一下，不胜感激！
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有你，有我
1楼 2012-06-29 17:15:08
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