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liliuping2

木虫 (正式写手)

[求助] 关于质谱测定蛋白质分子量的图谱分析

送蛋白样品出去测质谱,目的是测定分子量,用的是MALDI-TOP质谱仪,标准品与测试样图谱分别如下,回来后就给两个图谱,也木有啥分析,不知道是到底是分子量分析还是酶切后半胱氨酸分析,大家帮忙分析一下这谱图。

标准样



测试样
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质谱解析

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dshlove

木虫 (正式写手)

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感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+3, 鼓励发帖交流问题。 2012-06-20 20:37:19
你先对照你的蛋白分子量看看啊,我看不像是酶切之后的,倒像是直接给你样品分析的,不知道你的样品纯度如何?
2楼2012-06-20 17:03:45
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dshlove

木虫 (正式写手)

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引用回帖:
3楼: Originally posted by liliuping2 at 2012-06-20 20:02:05
样品WM大概在20kda左右,纯度可以达到90%的,我是想把这两个图放论文中,可是也不知道怎么讨论,只能说由于仪器误差导致的测试误差...

说实话MALDI的我没用过,只知道些大致原理。产生的离子多是单电荷离子,这一点与ESI十分不同,所以上面显示的基本是你的分子量再减去1,当然这要把参考离子的误差算在内。
6楼2012-06-21 08:53:52
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dshlove

木虫 (正式写手)

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引用回帖:
4楼: Originally posted by 月月大可 at 2012-06-20 21:42:54
呵呵,有点意思啊。我还不清楚这种仪器电离化的方法,但是你说了分子量是20kd,现在结果是20445,说明就是单电荷的。    我的理解标准品是用来给你分析误差的,表明是已知分子量,现在测试,你就能算出误差率。 然后 ...

这位朋友,MALDI产生的离子多是单电荷离子,与ESI不同。我理解的MALDI好像没有离子源之分,只有激光源波长种类的差别。不知对不对啊,互相交流啊。
7楼2012-06-21 08:56:56
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dshlove

木虫 (正式写手)

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引用回帖:
14楼: Originally posted by nannan2628 at 2013-05-17 15:32:16
您好,请问做质谱需要的样品纯度一般是什么样的情况呢?...

要看你用什么质谱了哦,理论上是不考虑样品纯度的,还有浓度不要太低啊。
15楼2013-05-17 17:02:06
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dshlove

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
wizardfan: 金币+2, 谢谢回答问题 2013-05-19 08:57:14
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16楼: Originally posted by nannan2628 at 2013-05-19 00:29:17
非常感谢您的回复O(∩_∩)O~
不用考虑杂质蛋白对目标蛋白的干扰吗?浓度应该不成问题,样品是用干粉自己配制的,浓度应该好控制的,您说的不要太低有没有具体的量的经验值呢?...

因为质谱本身就是要有检测多种物质的能力的,所以不能担心杂蛋白的影响、
我现在用的是单TOF,一般要求不低于0.5 mg/ml.
17楼2013-05-19 01:09:56
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