24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 907  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

十口木水

金虫 (小有名气)

[求助] 【求助】blast牛人帮忙

因为小弟要比对两个菌株的基因岛,现在得到A菌17个基因岛,B菌16个基因岛,怎么才能快速对两者进行比对呢?大三学生第一次做生物信息学,知识不够,希望各位大侠给个帮助,在这拜谢了!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★
yqbter: 金币+2, 鼓励发帖! 2012-07-06 13:19:21
你这种比较2个序列的叫做pairwise alignment,搜索下,很多软件。
当然也可以尝试下NCBI BLAST2SEQ
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... LAST_SPEC=blast2seq
5楼2012-07-05 20:28:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

十口木水

金虫 (小有名气)

没有人帮忙吗,求助啊!!!
2楼2012-06-18 22:18:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

schmyly

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
将A和B的序列分别做成fasta文件。下载blast-2.2.26+本地安装,先用A或B的序列建库,再用B或A的序列blastn命令比对序列和库。
3楼2012-06-19 08:24:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gungunak47

铁虫 (初入文坛)


【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
yqbter: 金币+2, 鼓励发帖! 2012-07-06 13:19:14
如果仅对A B 进行比对,可下载 DNAMAN软件,用起来很方便直观
4楼2012-06-19 10:05:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料专硕调剂 +8 椰椰。 2026-03-29 8/400 2026-03-30 11:08 by klasasda
[考研] 化学308分调剂 +7 你好明天你好 2026-03-30 7/350 2026-03-30 11:02 by 1172367218
[考研] 279求调剂 +5 j的立方 2026-03-29 5/250 2026-03-30 10:48 by 唐沐儿
[考研] 一志愿南开大学0710生物学359求调剂 +5 兔兔兔111223314 2026-03-29 5/250 2026-03-30 10:41 by malone0211
[考研] 求调剂 +10 张zz111 2026-03-27 11/550 2026-03-30 09:17 by 无际的草原
[考研] 279求调剂 +4 蝶舞轻绕 2026-03-29 4/200 2026-03-29 09:45 by laoshidan
[考研] 压国家一区线,求导师收留,有恩必谢! +7 迷人的哈哈 2026-03-28 7/350 2026-03-28 16:47 by 催化大白
[考研] 材料277求调剂 +7 min3 2026-03-24 7/350 2026-03-28 11:39 by xuxiang
[考研] 材料求调剂 一志愿哈工大总分298分,前三科223分 +5 dongfang59 2026-03-27 5/250 2026-03-28 04:53 by wxiongid
[考研] 265求调剂11408 +3 刘小鹿lu 2026-03-27 3/150 2026-03-27 20:53 by nihaoar
[考研] 材料292调剂 +12 橘颂思美人 2026-03-23 12/600 2026-03-27 15:44 by caszguilin
[考研] 279 分 求调剂 +4 睡个好觉_16 2026-03-24 4/200 2026-03-27 15:05 by 醉在风里
[考研] 求调剂 +6 林之夕 2026-03-24 6/300 2026-03-27 08:38 by hypershenger
[考研] 求调剂 一志愿 本科 北科大 化学 343 +6 13831862839 2026-03-24 7/350 2026-03-26 22:57 by 不吃魚的貓
[考研] 327求调剂 +7 prayer13 2026-03-23 7/350 2026-03-26 20:48 by 不吃魚的貓
[考研] 一志愿 南京邮电大学 288分 材料考研 求调剂 +3 jl0720 2026-03-26 3/150 2026-03-26 13:39 by zzll406
[考研] 一志愿天津大学339材料与化工求调剂 +3 江往卖鱼 2026-03-26 3/150 2026-03-26 09:42 by 王小欠i
[考研] 07化学303求调剂 +5 睿08 2026-03-25 5/250 2026-03-25 22:46 by 418490947
[考研] 334分 一志愿武理-080500 材料求调剂 +4 李李不服输 2026-03-25 4/200 2026-03-25 21:26 by 星空星月
[考研] 材料与化工304求B区调剂 +3 邱gl 2026-03-25 3/150 2026-03-25 19:03 by Ainin_
信息提示
请填处理意见