24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 906  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

十口木水

金虫 (小有名气)

[求助] 【求助】blast牛人帮忙

因为小弟要比对两个菌株的基因岛,现在得到A菌17个基因岛,B菌16个基因岛,怎么才能快速对两者进行比对呢?大三学生第一次做生物信息学,知识不够,希望各位大侠给个帮助,在这拜谢了!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★
yqbter: 金币+2, 鼓励发帖! 2012-07-06 13:19:21
你这种比较2个序列的叫做pairwise alignment,搜索下,很多软件。
当然也可以尝试下NCBI BLAST2SEQ
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... LAST_SPEC=blast2seq
5楼2012-07-05 20:28:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

十口木水

金虫 (小有名气)

没有人帮忙吗,求助啊!!!
2楼2012-06-18 22:18:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

schmyly

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
将A和B的序列分别做成fasta文件。下载blast-2.2.26+本地安装,先用A或B的序列建库,再用B或A的序列blastn命令比对序列和库。
3楼2012-06-19 08:24:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gungunak47

铁虫 (初入文坛)


【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
yqbter: 金币+2, 鼓励发帖! 2012-07-06 13:19:14
如果仅对A B 进行比对,可下载 DNAMAN软件,用起来很方便直观
4楼2012-06-19 10:05:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085600 材料与化工 329分求调剂 +13 Mr. Z 2026-03-25 13/650 2026-03-29 15:24 by 唐沐儿
[考研] 320分,材料与化工专业,求调剂 +9 一定上岸aaa 2026-03-27 13/650 2026-03-28 15:00 by 神马都不懂
[考研] 调剂 +3 好好读书。 2026-03-28 3/150 2026-03-28 12:04 by 王保杰33
[考研] 070300化学求调剂 +4 起个名咋这么难 2026-03-27 4/200 2026-03-27 21:39 by 83503孙老师
[考研] 一志愿211院校 344分 东北农业大学生物学学硕,求调剂 +5 丶风雪夜归人丶 2026-03-26 8/400 2026-03-27 19:22 by 丶风雪夜归人丶
[考研] 266分求材料化工冶金矿业等专业的调剂 +4 哇呼哼呼哼 2026-03-26 4/200 2026-03-27 17:02 by zhyzzh
[考研] 安徽大学专硕生物与医药专业(086000)324分,英语已过四六级,六级521,求调剂 +4 美味可乐鸡翅 2026-03-26 4/200 2026-03-27 15:27 by 星空星月
[考研] 274求调剂 +17 顾九笙要谦虚 2026-03-24 23/1150 2026-03-27 15:16 by caszguilin
[考研] 0703化学338求调剂! +6 Zuhui0306 2026-03-26 7/350 2026-03-27 10:35 by shangxh
[考研] 286求调剂 +4 lim0922 2026-03-26 4/200 2026-03-27 10:28 by guoweigw
[硕博家园] 北京林业大学硕导招生广告 +6 kongweilin 2026-03-26 8/400 2026-03-27 10:18 by FF_16
[考研] 317求调剂 +7 蛋黄咸肉粽 2026-03-26 7/350 2026-03-27 02:29 by fmesaito
[考研] 325求调剂 +5 李嘉图·S·路 2026-03-23 5/250 2026-03-27 00:42 by wxiongid
[考研] 一志愿河工大 081700 276求调剂 +4 地球绕着太阳转 2026-03-23 4/200 2026-03-26 14:27 by zzll406
[考研] 材料专硕找调剂 +5 哈哈哈吼吼吼哈 2026-03-23 5/250 2026-03-24 19:07 by 了了了了。。
[考研] 化工专硕求调剂 +3 question挽风 2026-03-24 3/150 2026-03-24 18:48 by jhhcooi
[考研] 一志愿南航材料专317分求调剂 +5 炸呀炸呀炸薯条 2026-03-23 5/250 2026-03-24 16:52 by 星空星月
[考研] 080500求调剂 +3 zzzzfan 2026-03-24 3/150 2026-03-24 16:38 by barlinike
[考研] 341求调剂(一志愿湖南大学070300) +5 番茄头--- 2026-03-22 6/300 2026-03-23 23:45 by Txy@872106
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境,总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-23 8/400 2026-03-23 20:36 by Creta
信息提示
请填处理意见