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行云流水cs

金虫 (小有名气)

[求助] 关于charge关键词的出错,请大家帮忙解决一下

出错的log文件在附件中
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  • 附件 1 : H2O.log
  • 2012-06-13 13:45:27, 6.02 K

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为无为,事无事,味无味。大小,多少,抱怨以德。图难乎其易也,为大乎其细也。
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书万里

木虫 (著名写手)

历史控+原著控

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2012-06-13 16:19:30
分子描述部分出现错误,键长键角必须是小数。
喂人民服雾。
2楼2012-06-13 13:59:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你是要算有点电荷存在下的水分子吗?刚好这几天我也在算。
没有见到你的完整输入。

我的输入如下,供查考:

# HF/6-311++G** POP=FULL  Charge  output=wfn   nosymm

H2O_2.0+

0,1
8         0.000000    0.113059    0.000000
1         0.752685   -0.452252    0.000000
1        -0.752685   -0.452220    0.000000

0.000000   2.000000    0.000000  1.0

D:\G09\G09 in out\H2O-+1\H2O_+\H2O_+.wfn

倒数第二行,“0.000000   2.000000    0.000000 ”,是点电荷的直角坐标,其后的 1.0是正1的点电荷。

[ Last edited by zhou2009 on 2012-6-13 at 15:08 ]
3楼2012-06-13 14:41:07
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行云流水cs

金虫 (小有名气)

zhou2009: 编辑内容 2012-06-13 15:11
引用回帖:
2楼: Originally posted by 书万里 at 2012-06-13 13:59:17
分子描述部分出现错误,键长键角必须是小数。

谢谢您,但是我还是想问你个问题。麻烦了。
输入文件中的
0 1
O
H     1   1.0000
H     1   1.0000    2    105.0000

2.0 2.0 2.0 1.2
2.0 -2.0 2.0 1.1

此处"2.0 2.0 2.0 1.2
       2.0 -2.0 2.0 1.1"
是什么意思啊。谢谢您啊

[ Last edited by zhou2009 on 2012-6-13 at 15:11 ]
为无为,事无事,味无味。大小,多少,抱怨以德。图难乎其易也,为大乎其细也。
4楼2012-06-13 14:42:45
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gmy1990: 金币+2 2012-06-13 16:19:18
引用回帖:
4楼: Originally posted by 行云流水cs at 2012-06-13 14:42:45
谢谢您,但是我还是想问你个问题。麻烦了。
输入文件中的
0 1
O
H     1   1.0000
H     1   1.0000    2    105.0000

2.0 2.0 2.0 1.2
2.0 -2.0 2.0 1.1

此处"2.0 2.0 2.0 1.2
       2.0 ...

应是两个点电荷的坐标和电荷数。
5楼2012-06-13 15:13:07
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qishiyy

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zhou2009 at 2012-06-13 14:41:07
你是要算有点电荷存在下的水分子吗?刚好这几天我也在算。
没有见到你的完整输入。

我的输入如下,供查考:

# HF/6-311++G** POP=FULL  Charge  output=wfn   nosymm

H2O_2.0+

0,1
8         0.00000 ...

要在指定位置加点电荷,在g09中说必须用标准方位指定,那么如何确定指定位置的标准方位呢,
6楼2012-07-24 10:30:00
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zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by qishiyy at 2012-07-24 10:30:00
要在指定位置加点电荷,在g09中说必须用标准方位指定,那么如何确定指定位置的标准方位呢,...

点电荷的直角坐标是否就是指定位置的标准方位呢。
7楼2012-07-24 10:49:11
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qishiyy

银虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by zhou2009 at 2012-07-24 10:49:11
点电荷的直角坐标是否就是指定位置的标准方位呢。...

In Gaussian 09, charges must be specified in the standard orientation (not the input orientation). Use the %KJob=L301 Link 0 command to quickly determine the standard orientation for a molecule.
体系的标准方位是程序内部根据输入的分子坐标为提高优化效率而生成的,标准方位的原点是分子内核电荷的中心。
点电荷的直角坐标不一定就是指定位置的标准方位,因为输入方位(input orientation)的中心不一定在分子的核电荷的中心。
所以,写输入文件时,点电荷的坐标怎么转换成标准方位呢
8楼2012-07-24 15:01:08
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