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chip实验超声问题已有2人参与
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大家好: 我所做细菌蛋白的chip实验。本实验的目的是用已获得的细菌蛋白鼠单抗,通过chip实验方法(用的是millipore的EZ-CHIP试剂盒),来筛选细菌体内可能与该蛋白有直接作用的DNA片段。 前2次做chip实验是2011年12月,实验还算顺利进行吧。超声破碎是该实验的重点,超声波把基因组打断为100-1000bp左右大小的片段。我前2次,用chip实验2%琼脂糖胶电泳超声波打断后的DNA片段,发现其DNA条带大小在100-500bp左右。 但是今天即2012-6-8重复该实验发现--超声破碎这步出现严重问题:1、用2ml EP管中有1ml的样品用小探头超声破碎,结果超声不足5个间隔就产生大量泡沫。 2、超声间隔为40s,超声5s;但是泡沫依然很多;3、在冰上超声,冰极易溶化,EP管位置可能有变化,探头碰壁;后用冰盒固定EP管,探头未碰壁,依然会产生很多泡沫。4、电泳发现,超声不完全。 所以请教大家提出宝贵意见,如何解决超声问题。谢谢回复 |
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