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cxzcz

新虫 (初入文坛)

[求助] CHIP问题 抗体问题

先介绍一下： 要研究真菌里面的一个转录因子调控的下游基因。计划做CHIP。第一去做目的蛋白的抗体。如果不做原核表达蛋白，直接用转录因子的CDNA全长去做抗原表位，能不能行？有没有做过的朋友？
  第二 做CHIP后筛选出来的未知的转录因子调控的靶基因，用何种方法研究它的功能等，要测序么？
  第三 关于真菌方面转录因子做CHIP的文献或者做过这方面工作的朋友有没有经验。试剂盒怎么样？
   金币少，没办法，只有衷心感谢！
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1楼 2011-07-06 19:43:35
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dream-fish

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
dhd997(金币+5): 非常热心 2011-07-09 09:38:02
我也没有多少CHIP的经验，看到没有人回就顶顶吧。
一：做抗体都是拿蛋白质去做，或者多肽，没有听说用cDNA去做，当然有的公司会帮你表达蛋白，有的要你自己表达而已。这个可以多联系几个公司就好了。
二：CHIP筛选出来的靶基因非常多，如果你之前没有验证你的目的蛋白结合的靶基因的话，那你就只有测序，现在这个也挺流行叫CHIP-Seqence。但是很烧钱，测序的结果还得分析后再用其他的方法来验证结果。
三：不做真菌，飘过~~~~~
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2楼2011-07-09 09:35:36
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yang0071

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
dhd997(金币+2): 鼓励交流 2011-07-18 12:44:59
要研究真菌里面的一个转录因子调控的下游基因。计划做CHIP。
1种可能，你老板很多钱，恭喜
第2种可能，你老板要你研究，你自己计划做chip。一般简单可行省钱的办法，先把IP作出来再说
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3楼2011-07-09 09:45:11
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wchuangqi

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
dhd997(金币+2): 鼓励交流 2011-07-18 12:45:08
要做抗体的话，首先要表达蛋白。目前大都在原核生物中表达。用全长做抗原的好像不多，但是有个软件可以预测基因编码蛋白的抗原表位，另外还要考虑选取的这段做出来的抗体，可不可以识别其同源基因。要研究该基因的靶基因，目前有钱的话，可以考虑做CHIP-Seqence，但是这些靶基因的具体功能，还需要具体研究。
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天道酬勤
4楼2011-07-18 11:04:39
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