24小时热门版块排行榜    

查看: 2142  |  回复: 3

guojj

铁虫 (初入文坛)

[交流] chip实验超声问题 已有2人参与

大家好:
    我所做细菌蛋白的chip实验。本实验的目的是用已获得的细菌蛋白鼠单抗,通过chip实验方法(用的是millipore的EZ-CHIP试剂盒),来筛选细菌体内可能与该蛋白有直接作用的DNA片段。
   前2次做chip实验是2011年12月,实验还算顺利进行吧。超声破碎是该实验的重点,超声波把基因组打断为100-1000bp左右大小的片段。我前2次,用chip实验2%琼脂糖胶电泳超声波打断后的DNA片段,发现其DNA条带大小在100-500bp左右。
   但是今天即2012-6-8重复该实验发现--超声破碎这步出现严重问题:1、用2ml EP管中有1ml的样品用小探头超声破碎,结果超声不足5个间隔就产生大量泡沫。
2、超声间隔为40s,超声5s;但是泡沫依然很多;3、在冰上超声,冰极易溶化,EP管位置可能有变化,探头碰壁;后用冰盒固定EP管,探头未碰壁,依然会产生很多泡沫。4、电泳发现,超声不完全。

    所以请教大家提出宝贵意见,如何解决超声问题。谢谢回复
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

helloflyab

铜虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你的超声功率太大,调小点试试
2楼2012-06-14 09:37:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guojj

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by helloflyab at 2012-06-14 09:37:05
你的超声功率太大,调小点试试

我拥的是宁波新芝的超声破碎仪,适合1.5ml的EP管超声的探头,功率不足40W,我今天处理的样品只有15ml的菌液,离心后经过处理,用1ml的溶液溶解在2mlEP管中。结果超声了30分钟,DNA片段长度约为2000-200bp 。做chip实验,超声这一步是基础,我前两次实验都可以把片段打断为1000-100bp 的。

所以,请提出宝贵意见,如何超声才能将片段打碎啊,是功率太小了?谢谢
3楼2012-06-14 20:33:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

88414774

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我想请教一下您超声破碎的具体参数,可否告知,万分感谢!!!
4楼2015-03-28 09:11:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 guojj 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +3 yuleib84 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:53 by jnhyjjm
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +8 家与远方 2026-08-10 13/650 2026-08-11 09:49 by 家与远方
[基金申请] 基金中了 +15 laoda193707 2026-08-06 15/750 2026-08-11 00:11 by jiafei2190
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +3 majunge000 2026-08-10 3/150 2026-08-10 15:46 by lch2012
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 好奇怪的filecode +4 布布和一二 2026-08-08 5/250 2026-08-10 14:20 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
信息提示
请填处理意见