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happywyh

铁虫 (小有名气)


[交流] NCBI序列 一定正确吗

之前根据NCBI上公布的某一蛋白基因序列(2.2kb)设计了对引物并成功构建了重组菌,目前还没有测到酶活,原因不明~~
现在查阅这个蛋白的早期文献(1971),发现这个蛋白约30kDa左右,明显的与NCBI公布的结果不合~~
两个是同一个菌
求解释~~
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steler_ly

铜虫 (正式写手)



happywyh(金币+1): 谢谢参与
由于数据库序列是各位研究者提交的,所以序列不一定是准确的。。。
2楼2012-06-06 11:43:18
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基诺莱普

禁言 (初入文坛)


happywyh(金币+1): 谢谢参与
本帖内容被屏蔽

3楼2012-06-06 11:47:57
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xzx018

铁杆木虫 (著名写手)



happywyh(金币+1): 谢谢参与
前段时间在小木虫上海看到一位仁兄为了毕业说自己编造了一段序列。。。。希望你们别碰到
4楼2012-06-06 15:41:30
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lw19850128

银虫 (小有名气)



happywyh(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
4楼: Originally posted by xzx018 at 2012-06-06 15:41:30
前段时间在小木虫上海看到一位仁兄为了毕业说自己编造了一段序列。。。。希望你们别碰到

汗。。。这仁兄也太狠了吧。。。
5楼2012-06-06 16:07:40
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zpf8573

新虫 (初入文坛)



happywyh(金币+1): 谢谢参与
正常了,提交序列的时候可以认为修改的!
6楼2012-06-06 17:07:23
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547star

木虫 (著名写手)



happywyh(金币+1): 谢谢参与
肯定要多方比较才能确认是否正确,相对而言SWISS-PROT的蛋白质序列更准确.
7楼2012-06-06 20:23:51
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跳跳鱼

木虫 (著名写手)



happywyh(金币+1): 谢谢参与
NCBI也是人们输入进去的  哪能保证全部正确
8楼2012-06-06 21:49:09
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王zmm

新虫 (初入文坛)



happywyh(金币+1): 谢谢参与
不能完全相信ncbi啊,他们在审核的时候不审核序列的。就是提交的不一定完全正确
9楼2012-06-07 10:32:00
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Rick001

铁杆木虫 (职业作家)



happywyh(金币+1): 谢谢参与
答案是不一定正确。
10楼2012-06-07 12:07:03
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zc10052157

新虫 (正式写手)



happywyh(金币+1): 谢谢参与
不大靠谱   以前搜过序列   翻译出来里面好多终止子
11楼2012-06-07 13:59:36
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xjntmy42

新虫 (正式写手)


★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小丹木木: 金币+2 2012-06-08 14:05:57
西方不论是期刊投稿,还是数据库提交生物信息数据,一般的假设都建立在信用的道德基础之上的,人为地捏造,改变数据只能让时间去证明。当然技术,实验手段缺陷造成的数据系统误差是另外一码事。一篇稿子,审稿人评审的前提是相信你数据的真实性,没有造假的。

[ Last edited by xjntmy42 on 2012-6-8 at 09:37 ]
12楼2012-06-08 09:35:41
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forget1997

银虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
人类基因组计划的数据都有错误的。更何况NCBI的数据只是个人测的
13楼2012-06-08 11:00:15
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zaasyangyong

金虫 (正式写手)


应该说不一定不准确
14楼2012-06-08 15:11:19
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happywyh

铁虫 (小有名气)


引用回帖:
14楼: Originally posted by zaasyangyong at 2012-06-08 15:11:19
应该说不一定不准确

进行全基因组测序时的某段基因注释有没有可能是错的
15楼2012-06-09 13:25:49
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847183376

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
不同的库是不一样的,比如有的库基因名字是RAS,有的是RAS ES12345678,你要都调出来看哪个是适合自己的啊
16楼2015-01-13 16:46:54
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