应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 量化图形可视化软件 » 同样的计算得到的fchk文件一个可以生成total density 的cube而另一个只能生成MO的
31/1返回列表
查看: 1747  |  回复: 2
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

夏天的娃

金虫 (小有名气)

[交流] 同样的计算得到的fchk文件一个可以生成total density 的cube而另一个只能生成MO的

很奇怪，我做两个分子片段相互作用的计算，# opt freq rb3lyp/6-31+g(d) geom=connectivity counterpoise=2 pop=chelpg
计算在是传到unix下用G09进行的，得到chk文件转化成fchk后下载到wimdows下载GV里想看看静电势，两个对应的文件件附件。用GV5.0打开fchk后，a01的生成cube那一栏只有MO可以选，其他total density和ESP什么的都是灰色，而d01文件除了MO外，total density和ESP都是黑色，选了后可以做出静电势图。
在坛子上搜了搜，尝试了在服务器上通过cubegen命令对fchk文件操作，产生电子密度和静电势的两个cube文件，但是对于a01文件会出现报错“ Could not find   Total SCF Density on formatted checkpoint file.”
还有一个奇怪现象，我都做了频率计算，但是在a01的fchk里可以查看到频率，但是d01的result里频率那一项是灰色。。很晕。。
做了其他几个同类计算也出现过不能生成ESP的cube的情况。求指导。。我把文件传上来。。~~[ Last edited by 夏天的娃 on 2012-6-5 at 17:32 ]
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : MS-W_a0.fchk
    • 2012-06-05 11:23:02, 381.08 K
  • 附件 2 : MS-W_a0.gjf
    • 2012-06-05 11:23:03, 1005 bytes
  • 附件 3 : MS-W_a0.out
    • 2012-06-05 11:23:07, 789.91 K
  • 附件 4 : MS-W_d0.fchk
    • 2012-06-05 11:23:08, 623.73 K
  • 附件 5 : MS-W_d0.gjf
    • 2012-06-05 11:23:10, 1005 bytes
  • 附件 6 : MS-W_d0.out
    • 2012-06-05 11:23:12, 1.87 M

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2012-06-05 11:24:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

夏天的娃

金虫 (小有名气)
UP一下，昨天计算几个类似的，也是出现fchk文件不能生成total density 和esp但是能够生成MO 的cube的。。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2012-06-06 09:32:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

我是你的风景

新虫 (初入文坛)
★
夏天的娃(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
2楼: Originally posted by 夏天的娃 at 2012-06-06 09:32:46
UP一下，昨天计算几个类似的，也是出现fchk文件不能生成total density 和esp但是能够生成MO 的cube的。。

你好，找到解决办法了吗？我也是一样的情况
赞一下 回复此楼
3楼2019-12-03 18:43:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 夏天的娃 的主题更新
31/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭