24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 1726  |  回复: 2
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

夏天的娃

金虫 (小有名气)


[交流] 同样的计算得到的fchk文件一个可以生成total density 的cube而另一个只能生成MO的

很奇怪,我做两个分子片段相互作用的计算,# opt freq rb3lyp/6-31+g(d) geom=connectivity counterpoise=2 pop=chelpg
计算在是传到unix下用G09进行的,得到chk文件转化成fchk后下载到wimdows下载GV里想看看静电势,两个对应的文件件附件。用GV5.0打开fchk后,a01的生成cube那一栏只有MO可以选,其他total density和ESP什么的都是灰色,而d01文件除了MO外,total density和ESP都是黑色,选了后可以做出静电势图。
在坛子上搜了搜,尝试了在服务器上通过cubegen命令对fchk文件操作,产生电子密度和静电势的两个cube文件,但是对于a01文件会出现报错“ Could not find   Total SCF Density on formatted checkpoint file.”
还有一个奇怪现象,我都做了频率计算,但是在a01的fchk里可以查看到频率,但是d01的result里频率那一项是灰色。。很晕。
做了其他几个同类计算也出现过不能生成ESP的cube的情况。求指导。。我把文件传上来。。~~[ Last edited by 夏天的娃 on 2012-6-5 at 17:32 ]
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : MS-W_a0.fchk
  • 2012-06-05 11:23:02, 381.08 K
  • 附件 2 : MS-W_a0.gjf
  • 2012-06-05 11:23:03, 1005 bytes
  • 附件 3 : MS-W_a0.out
  • 2012-06-05 11:23:07, 789.91 K
  • 附件 4 : MS-W_d0.fchk
  • 2012-06-05 11:23:08, 623.73 K
  • 附件 5 : MS-W_d0.gjf
  • 2012-06-05 11:23:10, 1005 bytes
  • 附件 6 : MS-W_d0.out
  • 2012-06-05 11:23:12, 1.87 M

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

夏天的娃

金虫 (小有名气)


UP一下,昨天计算几个类似的,也是出现fchk文件不能生成total density 和esp但是能够生成MO 的cube的。。
2楼2012-06-06 09:32:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 夏天的娃 的主题更新
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见