[交流] Autodock可以分析氢键吗

2楼: Originally posted by 药物设计 at 2012-05-23 15:34:00:
分析氢键？ 是显示可能形成的氢键？还是氢键形成的概率？

4楼: Originally posted by 药物设计 at 2012-05-24 09:43:38:
在结果分析里面，导入大分子和对接的结果后，show interaction （显示相互作用）就会出现了，详情请阅读autodock说明书（百度也有中文教程）。

6楼: Originally posted by 药物设计 at 2012-05-25 08:36:58:
首先应考虑是否一定会形成氢键，可以通过限制性对接，强制形成必要的氢键。其次，可以采用分子动力学研究蛋白和配体在水溶液中形成的稳态形式，可以计算相互作用的能量和PBSA或者GBSA计算氢键形成的概率。