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liuqun

木虫 (小有名气)

[求助] VASP过渡态数据处理

已经用CIneb计算出结果了,也用nebresults.pl处理了结果了,可是不会看生成的那些文件,哪位大师能指点一下我呢
1. 找到的过渡态怎么计算频率来确定找到的就是过渡态呢?
2. 用脚本处理后的结果,怎么才能做出一张图呢,就是有反应物中间过渡态,后边产物的那个图。
    必有重谢!
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likai0106

金虫 (小有名气)

★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2012-05-28 08:30:21
引用回帖:
5楼: Originally posted by liuqun at 2012-05-28 07:20:01
是在OUT文件夹里直接输nebresult.pl吗?但是他总是提醒我没有KPOINT INCAR POTCAR,是不是得把这三个文件再粘到01...0n文件夹里呢。
    还有就是out文件夹里的第一个文件夹里是00,总是提醒我找不到OUTCAR,我是 ...

例如你的计算文件夹是12345,在12345中有你计算要用的INCAR,KPOINTS,POTCAR和00,01,02,03,04,05(假设只有四个images)。计算后直接在12345/这个文件夹下输入nebresult.pl就行了。
6楼2012-05-28 08:11:08
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likai0106

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与,应助指数 +1
liuqun: 金币+60, 有帮助 2012-05-23 12:52:36
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2012-05-23 13:23:46
处理后有一mep.eps的文件,这个文件可以用photoshop去看。
如果想手动作图有一个spline.dat的文件可以用Origin等作图软件作图。spline.dat有四列,我一般作图取的是第一列(横坐标)和第三列(纵坐标)就和mep.eps的图像是一致的。

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2楼2012-05-23 10:38:08
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liuqun

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by likai0106 at 2012-05-23 10:38:08
处理后有一mep.eps的文件,这个文件可以用photoshop去看。
如果想手动作图有一个spline.dat的文件可以用Origin等作图软件作图。spline.dat有四列,我一般作图取的是第一列(横坐标)和第三列(纵坐标)就和mep.eps ...

你好:
    我刚发现用脚本只能处理几个image中的一个,我是用nebresult.
pl 01这样处理的,不知道对不对,能不能一块把几个images一块处理了呢?把这几个images的能量一块生成一个文件夹
3楼2012-05-27 07:45:52
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likai0106

金虫 (小有名气)


liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-05-27 09:43:57
引用回帖:
3楼: Originally posted by liuqun at 2012-05-27 07:45:52
你好:
    我刚发现用脚本只能处理几个image中的一个,我是用nebresult.
pl 01这样处理的,不知道对不对,能不能一块把几个images一块处理了呢?把这几个images的能量一块生成一个文件夹...

一般来说当你直接输入nebresult.pl后,输出结果会把01 ....0n结合起来处理成一个势能曲线和一些能垒分析的数据。

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4楼2012-05-27 08:15:09
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