应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » gromacs oplsaa 力场中的原子类型
51/1返回列表
查看: 3018  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

mengsk

金虫 (著名写手)

[求助] gromacs oplsaa 力场中的原子类型

请高手给个gromacs oplsaa 力场，个原子类型的描述，如：CA, CB, CW, C_2, C_3 各是什么类型的C原子？或者给个网站或数据库之类的。谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
奋斗中的小木虫
1楼 2012-05-22 11:05:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

604758762

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-05-25 10:54:29
引用回帖:
3楼: Originally posted by mengsk at 2012-05-25 09:59:58
请问你是指 ffbonded.itp, ffnonbonded.itp, forcefield.itp, gbsa.itp 还是什么？我看了里面没有具体的描述。问了师兄，也都说没见到具体描述。请你说得具体点好吗？谢谢!

应该是在.rtp文件里面，和上面说的几个文件在一个文件夹下
赞一下 回复此楼
4楼2012-05-25 10:41:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

604758762

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-22 20:55:24
在gromacs安装软件的top里面有
赞一下 回复此楼
2楼2012-05-22 20:46:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mengsk

金虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 604758762 at 2012-05-22 20:46:52
在gromacs安装软件的top里面有

请问你是指 ffbonded.itp, ffnonbonded.itp, forcefield.itp, gbsa.itp 还是什么？我看了里面没有具体的描述。问了师兄，也都说没见到具体描述。请你说得具体点好吗？谢谢!
赞一下 回复此楼
奋斗中的小木虫
3楼2012-05-25 09:59:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mengsk

金虫 (著名写手)
rtp是写残基力场的输入文件，怎么可能会有原子类型的具体描述。不是想生气，是的很上火，也不确定自己的回答是否是别人需要的，至少我再回答之前肯定会自己先check一下。还有一些有过几年学习经验的人，可能真懂得不少，但是对别人的问题回答的很笼统，耍官腔，有些甚至是错的。也请管理员至少大概看一下回帖的人回答的是否靠谱再给加分之类的，营造一个好的学术环境也是很重要的。我发了几次求助文献的，回帖的人完全不靠谱，竟然也给加金币，加金币事小，我这问题还没解决你给来个已经完成，别人也就不能来帮助我了啊！这世道真是无语，各行各业都一个德行！
赞一下(1人) 回复此楼
奋斗中的小木虫
5楼2012-05-28 17:31:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿京区985，085401，与本科专业一致，电子信息工程， +3 阳光开朗的男孩 2026-04-10 3/150 2026-04-10 15:15 by hemengdong
[考研] 机械专368 有去处吗 +3 种大树 2026-04-10 3/150 2026-04-10 15:13 by hemengdong
[考研] 085800 能源动力求调剂 +6 阿biu啊啊啊啊啊 2026-04-10 6/300 2026-04-10 15:03 by hemengdong
[考研] 080500求调剂 +14 黄宇博 2026-04-06 14/700 2026-04-10 13:09 by vgtyfty
[考研] 284求调剂 +18 梵@@ 2026-04-06 18/900 2026-04-10 10:12 by may_新宇
[考研] 083200 305分 求二轮调剂 不接受跨专业 +8 Claireyyyy 2026-04-09 8/400 2026-04-10 10:05 by luosha500
[考研] 296求调剂 +6 汪！？！ 2026-04-09 6/300 2026-04-09 20:49 by lbsjt
[考研] 070300化学 求调剂 +13 73372112 2026-04-08 13/650 2026-04-09 20:22 by maddjdld
[考研] 085600材料与化工301分求调剂院校 +33 刺痛jk 2026-04-06 34/1700 2026-04-09 18:31 by hy861222
[考研] 一志愿中科院105500专业总分315求调剂 +6 lallalh 2026-04-09 7/350 2026-04-09 17:51 by lallalh
[考研] 一志愿南京航空航天大学 材料与化工329分求调剂 +11 Mr. Z 2026-04-05 12/600 2026-04-08 16:15 by luoyongfeng
[考研] 264求调剂 +11 麦小叮当 2026-04-07 11/550 2026-04-08 16:05 by 一只好果子?
[考研] 307求调剂 +14 超级伊昂大王 2026-04-06 14/700 2026-04-08 07:03 by 无际的草原
[考研] 307求调剂 +3 Youth@@ 2026-04-07 3/150 2026-04-07 22:00 by hemengdong
[考研] 农学，求调剂，314分 +4 访客记录可爱 2026-04-04 4/200 2026-04-07 21:07 by 等岸
[考研] 071000生物学，一志愿深圳大学296分，求调剂 +12 TIckLw 2026-04-06 13/650 2026-04-07 20:34 by lijunpoly
[考研] 312求调剂 +4 LR6 2026-04-06 4/200 2026-04-07 08:42 by jp9609
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +5 崔wj 2026-04-05 5/250 2026-04-06 15:40 by lin-da
[考研] 319求调剂 +3 handrui 2026-04-05 3/150 2026-04-06 09:33 by jp9609
[考研] 331求调剂 +8 于征yz 2026-04-05 8/400 2026-04-06 00:54 by fmesaito
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭