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people2416

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 求助 弱氢键要不要写入CIF文件中

各位大侠,我是学有机化学的,单晶这块是小菜鸟,我有个单晶,用XP看了氢键如下:

Hydrogen bonds with  H..A < r(A) + 2.000 Angstroms  and   110 deg.

D-H           d(D-H)   d(H..A)   
N1-H1A         0.900    2.266   157.11    3.114    Cl1

N1-H1B         0.900    2.193   174.54    3.091    Cl1 [ x-1/2, -y+1/2, -z+1 ]

但是我用PWT软件查看了氢键,还有一个分子内氢键,如下:
D-H          H...A        D...A        <(DHA)

  0.96         2.54         2.872(2)     100.2        C11-H11B...N2
然后我就用XP中用HTAB 命令将C11-H11B...N2
在CIF文件中显示出来了,不知道这样对不对,应不应该把这个H键写进去啊,另外,如果写进去了,那么PLATON 是不是写在software used to prepare material for publication这里啊,如果不是应该写在哪里?请大侠么支招???
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Giji521

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖交流! 2012-05-19 11:03:57
linhua0402313: 专家考核 2012-05-19 11:04:02
people2416: 金币+5 2012-06-06 18:52:07
既然检测出来了就要写进去
2楼2012-05-19 10:59:31
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people2416

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Giji521 at 2012-05-19 10:59:31:
既然检测出来了就要写进去

我想发Acta E 那我问下PLATON 这个软件是不是写在software used to prepare material for publication这里啊,如果不是应该写在哪里?谢谢你
3楼2012-05-19 11:51:51
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闫璟2011

至尊木虫 (著名写手)

大景&眼睛

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
people2416: 金币+5 2012-06-06 18:52:12
应该不用写吧,一般CIF没有,用PLATON 转化后自动生成了弱H键~不知道回答对不对~
4楼2012-06-02 21:19:02
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