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guojj

铁虫 (初入文坛)

[交流] 蛋白激酶原核表达已有5人参与

大家好:
    我先要原核表达纯化一中丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶, 我们实验室做的是细菌,一般用PET-28a或32a表达载体,转入BL21中,上Ni柱亲和纯化重组蛋白。开始原核表达前会分析该蛋白的信号肽、跨膜区,一般去除跨膜区再原核表达的。我的问题是:
     1、我要表达的这个丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶由660个氨基酸组成,跨膜区在中间,即蛋白一部分在膜内,一半在膜外。若去除跨膜区,蛋白活性会不会有影响?因为该蛋白是一种激酶。
    2、若全长表达,编码基因过长我。现在是全长克隆,刚连上PMD18-T载体,转化后挑阳性克隆测序,测序序列与我们目的基因序列不能100%吻合,已测过6次序列,均不能100%成功。怎么办呢?
    3、表达载体要不要换呢?
    欢迎各位提出宝贵意见,谢谢。
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dshlove

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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silicare: 金币+6, BioEPI+1, 应助指数+1, 第二个需要高保真酶pfu,taq是不行的 2012-05-22 12:58:32
因为我最近在做肠激酶,所以给你说说我的想法。
第一个问题:你首先要确定你的蛋白,去NCBI或者uniport,找出相对应的序列,上面有活性位点的区域标识,你把你的跨膜区表达蛋白序列区间去比对,看是不是在活性区间内。才能确定是否影响。
第二个问题,说明你的insert有问题,要不就是在准备提质粒过程中生长突变了,不过可能性不大。还有最大可能就是你PCR目的基因片段时候的Taq酶有问题,建议你试试takara master mix试试,我们最近也换这种的,效果很好,P的也快。
第三个问题,如果你的载体能连接上目的基因就是没问题的,那就不要换了,省的还要重新设计引物,还要P载体。
好像就这么多了。希望能帮上你。
7楼2012-05-22 09:08:13
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丫头7976

铜虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
660也不算大,那你就重新PCR然后连T载体,你的pcr酶要用高保真的,否则就很容易出现碱基突变的
2楼2012-05-20 08:43:17
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guojj

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 丫头7976 at 2012-05-20 08:43:17:
660也不算大,那你就重新PCR然后连T载体,你的pcr酶要用高保真的,否则就很容易出现碱基突变的

谢谢回复。请推荐一种高保真的pcr酶。我们一直用TaRaKa的ExTaq酶,但对于2000bp好像有突变啊。
3楼2012-05-20 13:24:31
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shenlin0514

木虫 (正式写手)

无名小虫


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
建议你多查查外文文献,肯定有关于蛋白激酶原核表达的文章,你的目的基因并不大,如果测序出现突变,你可以1. 更换PCR酶,使用高保真的酶,如果连接T载体,回收后再进行加A反应,2. 设计纠正引物。
我们做3000bp的基因一般都是一次成功,很少出现突变的,用的酶是takara的pyrobest DNA polymerase

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Never say never
4楼2012-05-21 09:17:30
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