| 查看: 1192 | 回复: 11 | |||
[交流]
关于treefinder软件的一些问题？
|
|||
|
最近我在使用软件treefinder的过程中，遇到了一些问题：我的treefinder是2008年版本的，我通过jMODELTEST筛选出的模型如下： Model selected: Model = TPM2uf+G partition = 010212 -lnL = 2194.0723 K = 54 freqA = 0.2681 freqC = 0.2730 freqG = 0.1482 freqT = 0.3107 R(a) [AC] = 3.1465 R(b) [AG] = 25.9666 R(c) [AT] = 3.1465 R(d) [CG] = 1.0000 R(e) [CT] = 25.9666 R(f) [GT] = 1.0000 gamma shape = 0.5840 但是在treefinder中我找不到该模型，通过看说明在treefinder的Model输入框中输入代码： TPM2uf [{3.1465,25.9666,3.1465,1.0000,25.9666,1.0000} , {0.2681,0.2730,0.1482,0.3107}]:G[{0.5840}]:4，partition rates改为 010212 会出现错误: "reconstructphylogeny: bad substitution model"，所以想请教各位大侠：应该怎样才能将Jmodeltest中筛选出的模型应用到treefinder中？ [ Last edited by sunchao159 on 2012-5-9 at 20:44 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
最近几年招的学生写论文不引自己组发的文章
已经有5人回复
-
职称评审没过，求安慰
已经有54人回复
-
26申博自荐
已经有3人回复
-
A期刊撤稿
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 关于盐水洗涤的问题
已经有8人回复
- 急~~~ACS 版权协议问题
已经有7人回复
- 催化剂负载流失问题求助
已经有6人回复
- 畅所欲言：Acta E杂志问题及解答 奖励多多 欢迎参与
已经有29人回复
- 关于原生质体制备的问题
已经有24人回复
- 在做土壤学试验中遇到一些关于微生物的问题，急求解决！谢谢！
已经有8人回复
- 请教关于MTT脾淋巴细胞增殖问题
已经有11人回复
- 关于缩醛型表面活性剂的一些问题
已经有5人回复
- 关于Au111表面吸附能大小的问题
已经有4人回复
- 有关于MIC99测定的若干问题求助
已经有5人回复
- 求助关于动电位扫描测得极化曲线的问题
已经有3人回复
- 【求助】关于类风湿一些问题的咨询
已经有10人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
虚位以待，共探前沿：热烈欢迎报考北京工业大学纳米多孔材料课题组2026级博士研究生
+1/265
-
湖北大学食品安全研究团队诚招博士后
+1/182
-
Analytical Science Advances 征稿中
+1/179
-
湖南师范大学蒋乐勇教授课题组招收2026届“申请-考核”制博士生
+1/175
-
复旦大学化学系杰青/优青团队诚聘博士后
+3/150
-
接样SEM/XPS/XRD/FTIR/BET等多种测试/提供预存服务
+1/86
-
功能陶瓷材料和无机粉体合成博士后招聘启事
+1/80
-
天津大学化学系吴立朋课题组申请考核制博士招生/博后招聘
+1/80
-
宁波大学招聘科研助理1-2名
+1/53
-
【CSC招生】荷兰莱顿大学医学中心LKEB图像处理实验室 招收2026年CSC博士生多名
+1/38
-
博士招生
+1/32
-
有没有在ITO或者FTO玻璃上做好的CdS薄膜购买？
+1/31
-
湖南师范大学杨亚辉/江浩团队招收电催化方向2026年博士生1名
+1/27
-
中科大环境系张常勇教授课题组招聘副研/博士后（一人一议）
+1/21
-
SCI，计算机相关可以写
+1/5
-
中科院和北京工商大学招收2026博士/化学或生物背景
+1/4
-
北京师范大学与企业联合招聘博士后、全职、兼职人员
+1/4
-
实验室研究员
+1/3
-
英国兰卡斯特大学（Lancaster University）大模型、计算机视觉PhD招生
+1/2
-
有没有做核磁共振系统的虫友呢
+1/1
2楼2012-05-09 16:17:40
4楼2012-05-09 16:49:29
6楼2012-05-09 17:15:13
8楼2012-05-09 17:40:47
10楼2012-05-09 19:34:29
12楼2012-05-09 19:55:10
简单回复
2012-05-09 16:35
sunchao159(金币+1): 谢谢参与
假大空5楼
2012-05-09 17:09
sunchao159(金币+1): 谢谢参与
祝福
neu2347楼
2012-05-09 17:29
sunchao159(金币+1): 谢谢参与
曾经的我9楼
2012-05-09 17:41
sunchao159(金币+1): 谢谢参与
祝福
syhorchid11楼
2012-05-09 19:50
sunchao159(金币+1): 谢谢参与