| 查看: 1190 | 回复: 11 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
关于treefinder软件的一些问题？
|
|||
|
最近我在使用软件treefinder的过程中，遇到了一些问题：我的treefinder是2008年版本的，我通过jMODELTEST筛选出的模型如下： Model selected: Model = TPM2uf+G partition = 010212 -lnL = 2194.0723 K = 54 freqA = 0.2681 freqC = 0.2730 freqG = 0.1482 freqT = 0.3107 R(a) [AC] = 3.1465 R(b) [AG] = 25.9666 R(c) [AT] = 3.1465 R(d) [CG] = 1.0000 R(e) [CT] = 25.9666 R(f) [GT] = 1.0000 gamma shape = 0.5840 但是在treefinder中我找不到该模型，通过看说明在treefinder的Model输入框中输入代码： TPM2uf [{3.1465,25.9666,3.1465,1.0000,25.9666,1.0000} , {0.2681,0.2730,0.1482,0.3107}]:G[{0.5840}]:4，partition rates改为 010212 会出现错误: "reconstructphylogeny: bad substitution model"，所以想请教各位大侠：应该怎样才能将Jmodeltest中筛选出的模型应用到treefinder中？ [ Last edited by sunchao159 on 2012-5-9 at 20:44 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
最近几年招的学生写论文不引自己组发的文章
已经有5人回复
-
职称评审没过，求安慰
已经有54人回复
-
26申博自荐
已经有3人回复
-
A期刊撤稿
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 关于盐水洗涤的问题
已经有8人回复
- 急~~~ACS 版权协议问题
已经有7人回复
- 催化剂负载流失问题求助
已经有6人回复
- 畅所欲言：Acta E杂志问题及解答 奖励多多 欢迎参与
已经有29人回复
- 关于原生质体制备的问题
已经有24人回复
- 在做土壤学试验中遇到一些关于微生物的问题，急求解决！谢谢！
已经有8人回复
- 请教关于MTT脾淋巴细胞增殖问题
已经有11人回复
- 关于缩醛型表面活性剂的一些问题
已经有5人回复
- 关于Au111表面吸附能大小的问题
已经有4人回复
- 有关于MIC99测定的若干问题求助
已经有5人回复
- 求助关于动电位扫描测得极化曲线的问题
已经有3人回复
- 【求助】关于类风湿一些问题的咨询
已经有10人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
虚位以待，共探前沿：热烈欢迎报考北京工业大学纳米多孔材料课题组2026级博士研究生
+1/265
-
Analytical Science Advances 征稿中
+1/179
-
湖南师范大学蒋乐勇教授课题组招收2026届“申请-考核”制博士生
+1/175
-
天津大学化学系吴立朋课题组申请考核制博士招生/博后招聘
+1/81
-
功能陶瓷材料和无机粉体合成博士后招聘启事
+1/80
-
博士招生
+1/32
-
人到中年，还能干啥
+1/19
-
肿瘤免疫课题组招聘 博后
+1/13
-
澳门科技大学药学院诚招2026年秋季药剂学/生物材料方向博士研究生
+1/11
-
中南大学化学化工学院高性能聚合物团队2026年诚聘博士后或青年教师
+1/8
-
新加坡南洋理工大学材料科学与工程学院招收博士研究生 (2026年8月入学)
+1/6
-
诚邀博士后合作研究人员
+1/4
-
如何确定博后期间的研究方向？
+1/4
-
中科院和北京工商大学招收2026博士/化学或生物背景
+1/4
-
北京师范大学与企业联合招聘博士后、全职、兼职人员
+1/4
-
同济大学电信学院，肖李课题组预招2027春季与秋季博士生。
+1/3
-
浙江大学杨林课题组招聘药物化学与有机合成方向博士后
+1/3
-
英国兰卡斯特大学（Lancaster University）大模型、计算机视觉PhD招生
+1/2
-
有没有做核磁共振系统的虫友呢
+1/1
-
想读博士(理工/化学类/新能源材料)求大佬捞一下 ？或者师兄师姐推荐/建议博导招生信息
+1/1
10楼2012-05-09 19:34:29
2楼2012-05-09 16:17:40
6楼2012-05-09 17:15:13
8楼2012-05-09 17:40:47
简单回复
假大空5楼
2012-05-09 17:09
sunchao159(金币+1): 谢谢参与
祝福