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feierorange

铜虫 (小有名气)


[交流] 已知蛋白序列,如何得到对应的基因序列?

在NCBI里面查到了蛋白的序列,想要找到对应的基因的序列,应该怎么做呢,需要用到哪些软件?
请说的详细点啊,我是新手,请多多指教!
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njyang2006

金虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★
feierorange(金币+1): 谢谢参与
scelab: 金币+5, MicEPI+1, 谢谢热心交流~ :) 2012-05-07 22:10:47
NCBI里有蛋白序列就肯定可以查到对应的基因序列
例子如下:
myosin cross reactive antigen [Bifidobacterium breve]
GenBank: ADY18551.1

在NCBI的页面里,可以看到以下内容:
LOCUS       ADY18551         625 aa        linear   BCT 05-MAR-2011
DEFINITION  myosin cross reactive antigen, partial [Bifidobacterium breve].
ACCESSION   ADY18551
VERSION     ADY18551.1  GI:324310397
DBSOURCE    accession HQ593838.1

最后的这个DBSOURCE accession “HQ593838.1”,就是对应的基因序列。可以直接链接过去。

lz,可以在你的蛋白序列那个网页上仔细找一下!
2楼2012-05-07 22:02:36
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普通回帖

njyang2006

金虫 (正式写手)


还可以用你的蛋白序列进行BLAST,里面也会有对应的基因信息的
3楼2012-05-07 22:03:45
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qutao1720

金虫 (小有名气)


★
feierorange(金币+1): 谢谢参与
DNAMAN
4楼2012-05-07 22:46:25
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见神一笑

木虫 (著名写手)


★
feierorange(金币+1): 谢谢参与
primer premier 5也行。
5楼2012-05-08 08:43:34
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vizy

金虫 (正式写手)


★
feierorange(金币+1): 谢谢参与
我师姐说NTR
6楼2012-05-10 17:28:36
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