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已知蛋白序列,如何得到对应的基因序列?
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feierorange
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金币: 199.6
帖子: 134
在线: 70.3小时
虫号: 1605430
[交流]
已知蛋白序列,如何得到对应的基因序列?
在NCBI里面查到了蛋白的序列,想要找到对应的基因的序列,应该怎么做呢,需要用到哪些软件?
请说的详细点啊,我是新手,请多多指教!
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2012-05-07 16:49:44
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njyang2006
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feierorange(金币+1): 谢谢参与
scelab: 金币+5, MicEPI+1, 谢谢热心交流~ :)
2012-05-07 22:10:47
NCBI里有蛋白序列就肯定可以查到对应的基因序列
例子如下:
myosin cross reactive antigen [Bifidobacterium breve]
GenBank: ADY18551.1
在NCBI的页面里,可以看到以下内容:
LOCUS ADY18551 625 aa linear BCT 05-MAR-2011
DEFINITION myosin cross reactive antigen, partial [Bifidobacterium breve].
ACCESSION ADY18551
VERSION ADY18551.1 GI:324310397
DBSOURCE accession HQ593838.1
最后的这个DBSOURCE accession “HQ593838.1”,就是对应的基因序列。可以直接链接过去。
lz,可以在你的蛋白序列那个网页上仔细找一下!
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2012-05-07 22:02:36
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njyang2006
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还可以用你的蛋白序列进行BLAST,里面也会有对应的基因信息的
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3楼
2012-05-07 22:03:45
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