24小时热门版块排行榜    

查看: 2065  |  回复: 6

涛涛不绝1988

新虫 (初入文坛)

[求助] 鱼类线粒体DNA的提取 已有1人参与

我最近在做鱼类线粒体DNA的提取,用的常规的碱裂解法提取的,提了7、8次了,但是跑完胶之后除了Maker什么也没有,急啊~ 求高手帮忙分析一下,谢了!
(具体步骤:1、取动物组织2-8g,用SE缓冲夜漂洗,剪碎,加入约30mlSE缓冲液,0℃匀浆,1500rpm 10min,取上清 12000rpm 15min,沉淀物为线粒体,用STM溶液洗一遍。
2、以溶液体积与组织重量0.2ml:1g的STM溶液悬浮线粒体,加DNaseA溶液,(终浓度达到100ug/ml)30℃水浴30min,加EDTA溶液(至终浓度10mmol/L)摇匀,10000rpm 10min,沉淀即线粒体。
3、取部分线粒体用Janus Green B染色并观察线粒体的数目、大小。
4、剩余的线粒体用SE缓冲液洗一遍,然后用4mlSE溶液悬浮纯净线粒体,均分于4支EP管中。
5、12000rpm 10min;弃上清液,每管加150ulTEN溶液,悬浮沉淀,各加入300ul新配制的溶液Ⅴ,混合均匀,冰浴10min;再各加入225ul冷的KAc溶液,冰浴30min。
6、12000rpm 10min,取上清液; 加人与上清液等体积的饱和酚, 轻摇15min; 12000rpm 10min,取上清液; 加人与上清液等体积的氯仿-异戊醇(24 : 1 ) ,充分混合均匀,轻摇15min。12000rpm 10min, 吸取水相。
7、加入1/10体积的3mol/L、PH5.2的醋酸钠,再加入两倍体积无水乙醇,冰浴30min,12000rpm 10min,加入冷的(0℃)70%乙醇溶液洗一次,12000rpm 2min。自然干燥3-4 h或4℃ 冰箱中过夜彻底干燥;加入适量TE完全溶解。
8、加入DNase-free的RNaseA溶液(终浓度200ul/ml),37℃消化60min。重复步骤6和7。
9、取一部分溶液检测mtDNA的纯度和浓度,其余-20℃备用。)
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

Just do
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiayuling

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你选择的鱼组织最好用鱼的ganzang,这样提取 的线粒体DNA多
2楼2012-05-09 10:14:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

涛涛不绝1988

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xiayuling at 2012-05-09 10:14:26
你选择的鱼组织最好用鱼的ganzang,这样提取 的线粒体DNA多

肝脏、精巢、卵巢都试过,效果不理想!
Just do
3楼2012-08-17 19:46:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mitocam

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2012-08-18 15:16:41
问题可能在于DNAse。抽提过程中线粒体膜破裂,DNase把mtDNA给降解了。线粒体其实不是教科书所说的一粒一粒的,而是空间网状结构,抽提时就有可能线粒体膜破裂了。

能否不用DNase?染色体的DNA很长很大而且结合很多组蛋白,温和裂解细胞后很容易被离心沉淀下来的,而线粒体DNA小的多。所以用常用的RNA抽提办法,就可以抽提出RNA和mtDNA,然后用RNAase降解RNA,剩下的就是mtDNA。
4楼2012-08-18 05:55:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiayuling

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

动物的线粒体DNA很小,不应该用DNase,最后沉淀用无水乙醇,
5楼2012-08-18 17:24:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

涛涛不绝1988

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by mitocam at 2012-08-18 05:55:15
问题可能在于DNAse。抽提过程中线粒体膜破裂,DNase把mtDNA给降解了。线粒体其实不是教科书所说的一粒一粒的,而是空间网状结构,抽提时就有可能线粒体膜破裂了。

能否不用DNase?染色体的DNA很长很大而且结合很 ...

这是我毕设的时候的东西了,好久没看帖子了,现在不做这个了,不过还是谢谢你!
Just do
6楼2013-08-31 10:17:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

南海所老龚

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

电泳看不到条带很正常,你扩增几个片段试试,只要你前期提取方法正确,扩增是没问题的
TheBestandMostBeautifulThingsintheWorldCan'tBeSeenorTouched,TheyMustBeFeltwithHeart.
7楼2014-05-11 22:01:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 涛涛不绝1988 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-29 19:27 by cqwQDCxMcL3I
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 4/200 2026-09-29 16:54 by yCO1Ll7aHtsw
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 4/200 2026-09-29 16:47 by yCO1Ll7aHtsw
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 4/200 2026-09-29 16:37 by etmYJ6d2rquH
[博后之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 16:30 by etmYJ6d2rquH
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 16:03 by etmYJ6d2rquH
[博后之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 15:04 by etmYJ6d2rquH
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 14:58 by etmYJ6d2rquH
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 6/300 2026-09-29 14:41 by etmYJ6d2rquH
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 3/150 2026-09-29 14:30 by etmYJ6d2rquH
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 6/300 2026-09-29 14:13 by etmYJ6d2rquH
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 7/350 2026-09-29 14:07 by etmYJ6d2rquH
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 3/150 2026-09-29 13:56 by etmYJ6d2rquH
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 09:59 by JzYBbHIXWSrW
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:42 by ZvyPK8n6Nfki
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:28 by ZvyPK8n6Nfki
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 3/150 2026-09-28 23:12 by b8fCuTHqckEt
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:55 by ez6fGg9abYaj
[找工作] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 5/250 2026-09-28 22:32 by ez6fGg9abYaj
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 3/150 2026-09-28 19:08 by 9lS3ad5oOymn
信息提示
请填处理意见