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spit木虫 (小有名气)
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[求助]
用chem3d如何对分子进行优化，进而得到这些参数？
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有文献记载：“药物结构化学模型软件建立,用 mm2分子力学几何优化初始分子,得到初始分子几何参数,然后用改进的半经验法和AM1法几何优化全部分子结构 采用的参数 前线轨道能级 、生成热 偶极矩 整体硬度 和绝对电负性 以及部分原子所带的电荷”请问各位大侠 我用chem3d 如何优化呢？ 我是先画出分子式，点calculation-- MM2--Minimize energy。然后又点MMFF94--perform MMFF94 minimization.最后点GAMESS--Optimize to Transition State 这样对吗？那其他的选项 Molecular Dynamics 和computer Properties都是干什么的呢？ 我刚刚开始用这个软件，很菜。请大家多多指点！谢谢啦！  |
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木虫 (小有名气)
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2楼2012-05-02 21:55:22