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spit

木虫 (小有名气)

[求助] 用chem3d如何对分子进行优化,进而得到这些参数?

有文献记载:“药物结构化学模型软件建立,用 mm2分子力学几何优化初始分子,得到初始分子几何参数,然后用改进的半经验法和AM1法几何优化全部分子结构  采用的参数 前线轨道能级 、生成热 偶极矩 整体硬度 和绝对电负性 以及部分原子所带的电荷”请问各位大侠 我用chem3d 如何优化呢?
我是先画出分子式,点calculation-- MM2--Minimize energy。然后又点MMFF94--perform MMFF94 minimization.最后点GAMESS--Optimize to Transition State
这样对吗?那其他的选项 Molecular Dynamics 和computer Properties都是干什么的呢?
我刚刚开始用这个软件,很菜。请大家多多指点!谢谢啦!
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ine

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
spit: 金币+11, 有帮助 2012-05-03 21:27:55
spit: 金币+9, 有帮助 2012-05-04 20:12:39
spit: 金币+30, 有帮助, 高手都哪去了? 2012-05-05 16:17:27
没有人回答吗?同样等待答案...molecular dynamics [物] 分子动力学
幸福原本不多,珍惜累积渐长。
2楼2012-05-02 21:55:22
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