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如何获得转录调控网络?
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木虫
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虫号: 767756
[交流]
如何获得转录调控网络?
最近想研究转录调控网络,但寻找了一下,发现转录因子对基因的调控信息不知道如何获得。麻烦有经验的大侠们提供一些可供下载的数据库资源或者资料啊,最好是免费的。
注:我最近试了Transfac、JARSPAR、TRRD等,但发现它们都只是提供转录因子的结合位置序列信息,而不是具体结合的基因信息,并且有些还收费。
而我想知道的是转录因子到底都结合了哪些基因的启动子区!
谢谢大侠告知啊!
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1楼
2012-04-25 16:11:28
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木虫
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引用回帖:
28楼
:
Originally posted by
凌波丽
at 2013-09-27 10:35:36
转录因子数据库与转录因子预测软件
转录因子数据库:
TRANSFAC:
http://www.gene-regulation.com/pub/databses.html
TRRD:
http://wwwmgs.bionet.nsc.ru/mgs/gnw/trrd/
TFD:
http://www.ifti.org/
JASPAP ...
灰常感谢啊,很全很强大
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29楼
2014-04-14 15:07:55
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robertorun
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★ ★ ★
limits999(金币+1): 谢谢参与
zhaohq1209: 金币+2, 鼓励交流~
2012-04-27 13:10:02
那你去按结合位置序列信息去搜索比对基因的启动子区域,在由启动子找到对应的基因!
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limits999
2楼
2012-04-26 09:45:24
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shyu_en
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★
limits999(金币+1): 谢谢参与
说到底,这时候就看内功了,平时文献阅读量很重要的。
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6楼
2012-04-27 08:49:28
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凌波丽
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★ ★ ★
limits999(金币+1): 谢谢参与
zhaohq1209: 金币+2, 鼓励鼓励~
2012-04-27 13:10:14
你还是还先看些生物大分子网络的系统的基础参考书为好,很多东西不是一两句话说得清楚的。
BIOLOGICAL NETWORKS(2007)
http://ishare.iask.sina.com.cn/f/18454396.html
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7楼
2012-04-27 10:59:05
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