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hunter2010铁杆木虫 (著名写手)
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[求助]
超分子体系计算
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本人研究超分子体系弱相互作用计算，现在有几个问题要咨询下大家，望大家在空间时间帮我解答下，谢谢。 第一：我本人几何优化的时候，就是把2个分子根据主客体关系搭建了模型，进行几何优化收敛了，频率计算后无虚频，有内振动。后然用各种方法计算，指定opt=tight,int=tight,freq=hinderedrotor,仍旧提示Warning 40 free degree significant error 之类，后然查询频率校正因子，发现没有我用的基组的校正因子，就选了个0.950.几何优化频率都是使用DFT—D就行优化，不知道优化要不要counterpoise,我看有些文件几何优化用了，有些没有。 第二，模型搭建的时候，发现我自己搭建的和文献不一样，有些文件也是和我一样，根据化学性质，放两个分子进去，进行几何优化。但还有些文献写的是利用chem3D软件组建超分子构型，比如用chem3D组建NTO, H20超分子体系势能面上的各种可能构型。我不清楚怎么用chem3D组建超分子体系势能面上的各种可能构型？？构型搜索？？ 第三：[img]。请问这种图的分子间氢键和氢键键长画的，用什么软件  dimer |
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jiewei
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