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运行动力学模拟过程中H键势能一直为零?
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wangyiyongwz
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运行动力学模拟过程中H键势能一直为零?
为什么,在dynamic过程中氢键势能一直为零如下图:
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2012-04-24 17:03:40
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sikasun
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4楼
:
Originally posted by
wangyiyongwz
at 2012-04-25 09:01:57:
我用的是compass力场, 也就是说:意思是计算的总势能,其实已经包括了氢键的势能,只是氢键势能没有做单独计算,可以这样理解吗?
是的
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5楼
2012-04-25 09:13:27
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sikasun
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zh1987hs: 金币+2, 谢谢
2012-04-24 19:21:02
wangyiyongwz: 金币+2
2012-04-25 09:02:16
用是什么力场,有的力场没有单独算H键,有的如COMPASS是把H键归到范德华和静电相互作用中了。
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2楼
2012-04-24 17:19:43
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caijj09
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2楼
:
Originally posted by
sikasun
at 2012-04-24 17:19:43:
用是什么力场,有的力场没有单独算H键,有的如COMPASS是把H键归到范德华和静电相互作用中了。
那如果我想算氢键,该用什么力场?
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自强不息
3楼
2012-04-24 19:07:42
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wangyiyongwz
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2楼
:
Originally posted by
sikasun
at 2012-04-24 17:19:43:
用是什么力场,有的力场没有单独算H键,有的如COMPASS是把H键归到范德华和静电相互作用中了。
我用的是compass力场, 也就是说:意思是计算的总势能,其实已经包括了氢键的势能,只是氢键势能没有做单独计算,可以这样理解吗?
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4楼
2012-04-25 09:01:57
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