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wangyiyongwz

铜虫 (小有名气)

[求助] 运行动力学模拟过程中H键势能一直为零?

为什么,在dynamic过程中氢键势能一直为零如下图:
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sikasun

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-04-24 19:21:02
wangyiyongwz: 金币+2 2012-04-25 09:02:16
用是什么力场,有的力场没有单独算H键,有的如COMPASS是把H键归到范德华和静电相互作用中了。
2楼2012-04-24 17:19:43
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caijj09

木虫 (职业作家)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sikasun at 2012-04-24 17:19:43:
用是什么力场,有的力场没有单独算H键,有的如COMPASS是把H键归到范德华和静电相互作用中了。

那如果我想算氢键,该用什么力场?
自强不息
3楼2012-04-24 19:07:42
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wangyiyongwz

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sikasun at 2012-04-24 17:19:43:
用是什么力场,有的力场没有单独算H键,有的如COMPASS是把H键归到范德华和静电相互作用中了。

我用的是compass力场,  也就是说:意思是计算的总势能,其实已经包括了氢键的势能,只是氢键势能没有做单独计算,可以这样理解吗?
4楼2012-04-25 09:01:57
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sikasun

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by wangyiyongwz at 2012-04-25 09:01:57:
我用的是compass力场,  也就是说:意思是计算的总势能,其实已经包括了氢键的势能,只是氢键势能没有做单独计算,可以这样理解吗?

是的
5楼2012-04-25 09:13:27
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sikasun

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by caijj09 at 2012-04-24 19:07:42:
那如果我想算氢键,该用什么力场?

这个我也不是很清楚,你查一下力场的说明。
6楼2012-04-25 09:14:20
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wangyiyongwz

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by sikasun at 2012-04-25 09:13:27:
是的

好的,谢谢!
7楼2012-04-26 10:07:48
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