| 查看: 4064 | 回复: 7 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
关于fix nvt里的Tdamp
|
|||
|
请问一下大家，lammps的fix nvt里面的tdamp该怎么选取比较合适？ manual说最好是timestep的100倍左右。今天我进行多核并行模拟（试过6核、4核）的时候，设置步长为0.0005ps（units是metal，步长要设置成0.5fs，所以写0.0005），tdamp我设置为0.05，但run一些steps之后程序突然中止，tdamp改成0.1的话，run的步数正好是之前的两倍，随后也中止跳出。。。 请教论坛里的大牛tdamp到底应该怎么设置，对并行运算也会有影响吗？单核计算的话就不会出现这个问题，但单核实在太慢了。。。 |
回复此楼» 猜你喜欢
球磨粉体时遇到了大的问题，请指教！
已经有13人回复
-
情人节自我反思：在爱情中有过遗憾吗？
已经有5人回复
-
售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急
已经有6人回复
-
售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急
已经有9人回复
-
售SCI一区文章，我:8 O5 51O 54,科目齐全,可+急
已经有8人回复
-
江汉大学解明教授课题组招博士研究生/博士后
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 分子模拟中体系势能和总能量为很大的正值
已经有8人回复
- fix nvt 命令中Tdamp的含义
已经有12人回复
- 如何设置并行计算
已经有3人回复
- fix deform 指令拉伸求教
已经有10人回复
- 关于汽轮机几个英语简写
已经有6人回复
- 聚合物的模型，退火和NPT,NVT要做到什么程度就能保证结构合理？
已经有4人回复
- 【求助】LAMMPS-运行报错
已经有9人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
医学超声影像负责人招聘-中国科学院赣江创新研究院
+1/974
-
苏州国家实验室和中国科学技术大学联培博士招生
+1/178
-
ChineseResearchLaTeX: 开源、免费的vibe coding辅助国自然写作
+1/90
-
陆军军医大学第二附属医院（新桥医院）冉茜课题组招聘科研人员
+1/79
-
北京-89175-事业单位-诚征女友
+1/63
-
2025难忘的时刻
+1/62
-
上海理工大学2026年系统科学学科海外骨干教师招聘启事
+2/60
-
国家级青年人才课题组招收2026级硕士研究生
+1/41
-
国家级青年人才课题组招收2026级硕士研究生
+1/39
-
清华大学深圳国际研究生院招聘-博士后（长期有效）
+1/35
-
澳大利亚麦考瑞大学(Macquarie University)国际博士硕士全额奖学金-计算机-26年中开学
+1/32
-
中国农业大学安杰课题组招聘科研助理（表现优异者可提供读博机会）
+1/27
-
南京医科大学国家级高层次青年人才团队招收博士后
+1/17
-
香港中文大学（深圳）陈筱萌 课题组招生公告（博士 / 博后 / 硕士 / RA）
+1/13
-
国家“双一流”建设高校-南京林业大学-国家级青年人才团队 招2026级申请考核制博士
+1/8
-
澳门大学生物医学影像实验室诚招博士生（2026秋季入学）
+1/7
-
中国地质大学（武汉）杨华明课题组刘磊研究员招收冶金固废资源高值化利用方向博士
+1/6
-
南京大学能源与资源学院徐加陵课题组招聘：科研助理、硕士生、博士生
+1/6
-
代教授（南昌航空大学）招收CO2光&光热催化还原方向的博士生
+1/5
-
国内树枝状聚合物现在进入量产了吗？
+1/3
8楼2016-01-07 10:25:39
2楼2012-04-24 08:04:43
|
[proxy:0:0@lammps] HYDT_dmxu_poll_wait_for_event (./tools/demux/demux_poll.c:70): assert (!(pollfds.revents & ~POLLIN & ~POLLOUT & ~POLLHUP)) failed [proxy:0:0@lammps] main (./pm/pmiserv/pmip.c:225): demux engine error waiting for event [mpiexec@lammps] HYDT_bscu_wait_for_completion (./tools/bootstrap/utils/bscu_wait.c:99): one of the processes terminated badly; aborting [mpiexec@lammps] HYDT_bsci_wait_for_completion (./tools/bootstrap/src/bsci_wait.c:18): bootstrap device returned error waiting for completion [mpiexec@lammps] HYD_pmci_wait_for_completion (./pm/pmiserv/pmiserv_pmci.c:352): bootstrap server returned error waiting for completion [mpiexec@lammps] main (./ui/mpich/mpiexec.c:302): process manager error waiting for completion 这是今天报错的内容，我昨晚把tdamp改成0.025。。。运行中止。。。现在简直是盲人摸象的感觉啊 |
3楼2012-04-24 13:26:06
|
Memory usage per processor = 2.39259 Mbytes Step Temp E_pair E_mol TotEng Press 80150 278.46674 -705.38902 0 -700.92569 -19142.026 85000 353.46293 -704.73979 0 -699.07439 -16120.99 …… …… 180000 891.91995 -710.80657 0 -696.51064 -27161.183 185000 823.79471 -708.93996 0 -695.73597 -9021.5055 APPLICATION TERMINATED WITH THE EXIT STRING: Hangup (signal 1) 这是主题贴没写上去的报错的内容。。。只有一行而已，前面是thermo的内容。。。只算了10万步而已。。上一条回复是昨晚后来修改tdamp以后新的报错。。。  |
4楼2012-04-24 14:13:34