24小时热门版块排行榜    

查看: 4053  |  回复: 12

yongning88

铜虫 (小有名气)


[交流] fix nvt 命令中Tdamp的含义

那位大神能解释下,fix ID group-ID nvt temp Tstart Tstop Tdamp 中Tdamp的含义,
比如  fix 1 all nvt 600 300 50 这个例子,单位是metal

Manual中的句子不是很理解,
For example, a value of 10.0 means to relax the temperature in a timespan of (roughly) 10 time units.
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子动力学

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

zhang_jaj

木虫 (正式写手)


★ ★ ★
yongning88(金币+1): 谢谢参与
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-04-11 16:52:39
这个是在调节温度时引入的一个因子,让温度变化就像阻尼振动一样。越大的话,振幅越小,回归时间越久;越小的话,振幅就很大,相当于温度很大,阻尼力会使他很快回归到目标温度
6楼2013-04-10 22:56:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xujc1983

木虫 (著名写手)


引用回帖:
11楼: Originally posted by mileyfan at 2015-09-11 11:24:04
MD小白想请问下,这个Tdamp与coupling constant有关系么?
在一篇文献中曾看到:“employing the Bussi thermostat with a coupling constant of 100fs”,一直不太明白这是什么意思
谢谢了!...

就是指的这个
相当于在BUssi控温器下,每100fs对体系动能进行调整
12楼2015-09-11 13:02:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

yangwenbin99

铜虫 (小有名气)


★ ★
yongning88(金币+1): 谢谢参与
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-04-11 16:52:09
Tdamp不是温度阻尼吗
2楼2013-04-10 09:52:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yongning88

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
2楼: Originally posted by yangwenbin99 at 2013-04-10 09:52:04
Tdamp不是温度阻尼吗

就是不明白温度是怎么随时间变化的
4楼2013-04-10 10:59:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yongning88

铜虫 (小有名气)


引用回帖:
6楼: Originally posted by zhang_jaj at 2013-04-10 22:56:25
这个是在调节温度时引入的一个因子,让温度变化就像阻尼振动一样。越大的话,振幅越小,回归时间越久;越小的话,振幅就很大,相当于温度很大,阻尼力会使他很快回归到目标温度

那如果我想让温度以 10k/ps 的速度降温,该怎么设置呢
7楼2013-04-11 16:02:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

daicong

木虫 (小有名气)



yongning88(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
6楼: Originally posted by zhang_jaj at 2013-04-10 09:56:25
这个是在调节温度时引入的一个因子,让温度变化就像阻尼振动一样。越大的话,振幅越小,回归时间越久;越小的话,振幅就很大,相当于温度很大,阻尼力会使他很快回归到目标温度

请问这个值是否设置越小越好?
9楼2014-02-13 02:38:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xujc1983

木虫 (著名写手)


★ ★ ★
yongning88(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流! 2014-02-13 13:26:27
引用回帖:
9楼: Originally posted by daicong at 2014-02-13 02:38:41
请问这个值是否设置越小越好?...

最好做个测试吧
实际上表现出来的是体系与“热浴”之间的作用强度。值越小,说明热浴作用越强,与体系的热交换越强,速度(温度)控制越强。如果值很小的话,也会给体系带来很强的外部温度影响。
至于升温速度,跟这个参数关系不是很大。10k/ps 的速度降温,需要设置Tstart Tstop 和 run。
例如,Tstart为1000K,Tstop为100K,如果timestep为1fs,那么run设为90000 (90ps)
10楼2014-02-13 10:27:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mileyfan

新虫 (小有名气)



yongning88(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
10楼: Originally posted by xujc1983 at 2014-02-13 10:27:09
最好做个测试吧
实际上表现出来的是体系与“热浴”之间的作用强度。值越小,说明热浴作用越强,与体系的热交换越强,速度(温度)控制越强。如果值很小的话,也会给体系带来很强的外部温度影响。
至于升温速度, ...

MD小白想请问下,这个Tdamp与coupling constant有关系么?
在一篇文献中曾看到:“employing the Bussi thermostat with a coupling constant of 100fs”,一直不太明白这是什么意思
谢谢了!
11楼2015-09-11 11:24:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mileyfan

新虫 (小有名气)


引用回帖:
12楼: Originally posted by xujc1983 at 2015-09-11 13:02:35
就是指的这个
相当于在BUssi控温器下,每100fs对体系动能进行调整...

谢谢!
13楼2015-09-11 15:24:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
2013-04-10 09:55   回复  
yongning88(金币+1): 谢谢参与
sd-wmg5楼
2013-04-10 15:16   回复  
yongning88(金币+1): 谢谢参与
haixiawu8楼
2013-04-13 09:41   回复  
yongning88(金币+1): 谢谢参与
相关版块跳转 我要订阅楼主 yongning88 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 311求调剂 +9 冬十三 2026-03-15 10/500 2026-03-17 22:53 by lbsjt
[考研] 考研求调剂 +3 橘颂. 2026-03-17 4/200 2026-03-17 21:43 by 有只狸奴
[考研] 301求调剂 +4 A_JiXing 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:32 by ruiyingmiao
[考研] 332求调剂 +6 Zz版 2026-03-13 6/300 2026-03-17 17:03 by ruiyingmiao
[考研] 【0856】化学工程(085602)313 分,本科学科评估A类院校化学工程与工艺,诚求调剂 +7 小刘快快上岸 2026-03-11 8/400 2026-03-17 16:57 by ruiyingmiao
[考研] 290求调剂 +6 孔志浩 2026-03-12 11/550 2026-03-17 14:41 by 周舟舟77
[考研] 一志愿985,本科211,0817化学工程与技术319求调剂 +5 Liwangman 2026-03-15 5/250 2026-03-16 17:10 by 我的船我的海
[考研] 0703化学调剂 +6 妮妮ninicgb 2026-03-15 9/450 2026-03-16 16:40 by houyaoxu
[考博] 东华理工大学化材专业26届硕士博士申请 +6 zlingli 2026-03-13 6/300 2026-03-15 20:00 by ryzcf
[考研] 材料与化工 323 英一+数二+物化,一志愿:哈工大 本人本科双一流 +4 自由的_飞翔 2026-03-13 5/250 2026-03-14 19:39 by hmn_wj
[考研] 328求调剂 +3 5201314Lsy! 2026-03-13 6/300 2026-03-14 15:31 by hyswxzs
[考研] 330求调剂 +3 ?酱给调剂跪了 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:13 by JourneyLucky
[考研] 337一志愿华南理工0805材料求调剂 +7 mysdl 2026-03-11 9/450 2026-03-13 22:43 by JourneyLucky
[考研] 求材料调剂 +5 隔壁陈先生 2026-03-12 5/250 2026-03-13 22:03 by 星空星月
[考研] 304求调剂 +7 7712b 2026-03-13 7/350 2026-03-13 21:42 by peike
[考研] 0703化学一志愿211 总分320求调剂 +5 玛卡巴卡啊哈 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:40 by JourneyLucky
[考研] 314求调剂 +7 无懈可击的巨人 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:40 by JourneyLucky
[考研] 328化工专硕求调剂 +4 。,。,。,。i 2026-03-12 4/200 2026-03-13 14:44 by JourneyLucky
[考研] 289求调剂 +3 李政莹 2026-03-12 3/150 2026-03-13 11:02 by 求调剂zz
[考博] 2026年博士申请 +3 QwQwQW10 2026-03-11 3/150 2026-03-12 17:58 by gxch43
信息提示
请填处理意见