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fix nvt 命令中Tdamp的含义
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yongning88
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[交流]
fix nvt 命令中Tdamp的含义
那位大神能解释下,fix ID group-ID nvt temp Tstart Tstop Tdamp 中Tdamp的含义,
比如 fix 1 all nvt 600 300 50 这个例子,单位是metal
Manual中的句子不是很理解,
For example, a value of 10.0 means to relax the temperature in a timespan of (roughly) 10 time units.
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2013-04-10 09:32:56
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zhang_jaj
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yongning88(金币+1): 谢谢参与
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2013-04-11 16:52:39
这个是在调节温度时引入的一个因子,让温度变化就像阻尼振动一样。越大的话,振幅越小,回归时间越久;越小的话,振幅就很大,相当于温度很大,阻尼力会使他很快回归到目标温度
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6楼
2013-04-10 22:56:25
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xujc1983
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11楼
:
Originally posted by
mileyfan
at 2015-09-11 11:24:04
MD小白想请问下,这个Tdamp与coupling constant有关系么?
在一篇文献中曾看到:“employing the Bussi thermostat with a coupling constant of 100fs”,一直不太明白这是什么意思
谢谢了!...
就是指的这个
相当于在BUssi控温器下,每100fs对体系动能进行调整
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12楼
2015-09-11 13:02:35
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yangwenbin99
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chaizhm: 金币+1, 谢谢~
2013-04-11 16:52:09
Tdamp不是温度阻尼吗
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2楼
2013-04-10 09:52:04
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yongning88
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2楼
:
Originally posted by
yangwenbin99
at 2013-04-10 09:52:04
Tdamp不是温度阻尼吗
就是不明白温度是怎么随时间变化的
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4楼
2013-04-10 10:59:02
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yongning88
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6楼
:
Originally posted by
zhang_jaj
at 2013-04-10 22:56:25
这个是在调节温度时引入的一个因子,让温度变化就像阻尼振动一样。越大的话,振幅越小,回归时间越久;越小的话,振幅就很大,相当于温度很大,阻尼力会使他很快回归到目标温度
那如果我想让温度以 10k/ps 的速度降温,该怎么设置呢
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7楼
2013-04-11 16:02:44
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daicong
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yongning88(金币+1): 谢谢参与
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6楼
:
Originally posted by
zhang_jaj
at 2013-04-10 09:56:25
这个是在调节温度时引入的一个因子,让温度变化就像阻尼振动一样。越大的话,振幅越小,回归时间越久;越小的话,振幅就很大,相当于温度很大,阻尼力会使他很快回归到目标温度
请问这个值是否设置越小越好?
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9楼
2014-02-13 02:38:41
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xujc1983
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2014-02-13 13:26:27
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9楼
:
Originally posted by
daicong
at 2014-02-13 02:38:41
请问这个值是否设置越小越好?...
最好做个测试吧
实际上表现出来的是体系与“热浴”之间的作用强度。值越小,说明热浴作用越强,与体系的热交换越强,速度(温度)控制越强。如果值很小的话,也会给体系带来很强的外部温度影响。
至于升温速度,跟这个参数关系不是很大。10k/ps 的速度降温,需要设置Tstart Tstop 和 run。
例如,Tstart为1000K,Tstop为100K,如果timestep为1fs,那么run设为90000 (90ps)
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10楼
2014-02-13 10:27:09
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mileyfan
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10楼
:
Originally posted by
xujc1983
at 2014-02-13 10:27:09
最好做个测试吧
实际上表现出来的是体系与“热浴”之间的作用强度。值越小,说明热浴作用越强,与体系的热交换越强,速度(温度)控制越强。如果值很小的话,也会给体系带来很强的外部温度影响。
至于升温速度, ...
MD小白想请问下,这个Tdamp与coupling constant有关系么?
在一篇文献中曾看到:“employing the Bussi thermostat with a coupling constant of 100fs”,一直不太明白这是什么意思
谢谢了!
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11楼
2015-09-11 11:24:04
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mileyfan
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12楼
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Originally posted by
xujc1983
at 2015-09-11 13:02:35
就是指的这个
相当于在BUssi控温器下,每100fs对体系动能进行调整...
谢谢!
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13楼
2015-09-11 15:24:40
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失落的豇豆
3楼
2013-04-10 09:55
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sd-wmg
5楼
2013-04-10 15:16
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yongning88(金币+1): 谢谢参与
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8楼
2013-04-13 09:41
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yongning88(金币+1): 谢谢参与
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