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yongning88

铜虫 (小有名气)

[交流] fix nvt 命令中Tdamp的含义

那位大神能解释下，fix ID group-ID nvt temp Tstart Tstop Tdamp 中Tdamp的含义，
比如  fix 1 all nvt 600 300 50 这个例子，单位是metal

Manual中的句子不是很理解，
For example, a value of 10.0 means to relax the temperature in a timespan of (roughly) 10 time units.
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1楼 2013-04-10 09:32:56
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

zhang_jaj

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
yongning88(金币+1): 谢谢参与
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-04-11 16:52:39
这个是在调节温度时引入的一个因子，让温度变化就像阻尼振动一样。越大的话，振幅越小，回归时间越久；越小的话，振幅就很大，相当于温度很大，阻尼力会使他很快回归到目标温度
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6楼2013-04-10 22:56:25
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚
引用回帖:
11楼: Originally posted by mileyfan at 2015-09-11 11:24:04
MD小白想请问下，这个Tdamp与coupling constant有关系么？
在一篇文献中曾看到：“employing the Bussi thermostat with a coupling constant of 100fs”，一直不太明白这是什么意思
谢谢了！...

就是指的这个
相当于在BUssi控温器下，每100fs对体系动能进行调整
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12楼2015-09-11 13:02:35
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普通回帖

yangwenbin99

铜虫 (小有名气)
★ ★
yongning88(金币+1): 谢谢参与
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-04-11 16:52:09
Tdamp不是温度阻尼吗
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2楼2013-04-10 09:52:04
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yongning88

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yangwenbin99 at 2013-04-10 09:52:04
Tdamp不是温度阻尼吗

就是不明白温度是怎么随时间变化的
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4楼2013-04-10 10:59:02
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yongning88

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by zhang_jaj at 2013-04-10 22:56:25
这个是在调节温度时引入的一个因子，让温度变化就像阻尼振动一样。越大的话，振幅越小，回归时间越久；越小的话，振幅就很大，相当于温度很大，阻尼力会使他很快回归到目标温度

那如果我想让温度以 10k/ps 的速度降温，该怎么设置呢
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7楼2013-04-11 16:02:44
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daicong

木虫 (小有名气)
★
yongning88(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
6楼: Originally posted by zhang_jaj at 2013-04-10 09:56:25
这个是在调节温度时引入的一个因子，让温度变化就像阻尼振动一样。越大的话，振幅越小，回归时间越久；越小的话，振幅就很大，相当于温度很大，阻尼力会使他很快回归到目标温度

请问这个值是否设置越小越好？
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9楼2014-02-13 02:38:41
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xujc1983

木虫 (著名写手)

苦逼青椒一枚
★ ★ ★
yongning88(金币+1): 谢谢参与
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-02-13 13:26:27
引用回帖:
9楼: Originally posted by daicong at 2014-02-13 02:38:41
请问这个值是否设置越小越好？...

最好做个测试吧
实际上表现出来的是体系与“热浴”之间的作用强度。值越小，说明热浴作用越强，与体系的热交换越强，速度（温度）控制越强。如果值很小的话，也会给体系带来很强的外部温度影响。
至于升温速度，跟这个参数关系不是很大。10k/ps 的速度降温，需要设置Tstart Tstop 和 run。
例如，Tstart为1000K，Tstop为100K，如果timestep为1fs，那么run设为90000 （90ps）
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10楼2014-02-13 10:27:09
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mileyfan

新虫 (小有名气)
★
yongning88(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
10楼: Originally posted by xujc1983 at 2014-02-13 10:27:09
最好做个测试吧
实际上表现出来的是体系与“热浴”之间的作用强度。值越小，说明热浴作用越强，与体系的热交换越强，速度（温度）控制越强。如果值很小的话，也会给体系带来很强的外部温度影响。
至于升温速度， ...

MD小白想请问下，这个Tdamp与coupling constant有关系么？
在一篇文献中曾看到：“employing the Bussi thermostat with a coupling constant of 100fs”，一直不太明白这是什么意思
谢谢了！
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11楼2015-09-11 11:24:04
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mileyfan

新虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by xujc1983 at 2015-09-11 13:02:35
就是指的这个
相当于在BUssi控温器下，每100fs对体系动能进行调整...

谢谢！
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13楼2015-09-11 15:24:40
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失落的豇豆3楼
2013-04-10 09:55   回复  
yongning88(金币+1): 谢谢参与
sd-wmg5楼
2013-04-10 15:16   回复  
yongning88(金币+1): 谢谢参与
haixiawu8楼
2013-04-13 09:41   回复  
yongning88(金币+1): 谢谢参与
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