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903566945

金虫 (正式写手)

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专业: 绿色有机化学

[求助] AMBER原子类型怎么修改？

请教高手，AMBER里面原子类型修改的问题，如果我的小分子不在AMBER自带的力场内，那小分子原子类型改成什么才能让AMBER 识别呢？还有我跑了一圈Sand,怎么确定是正常结束的呢？

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1楼2012-04-17 20:38:21

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wangyan10

铁杆木虫 (正式写手)

应助: 36 (小学生)
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专业: 理论和计算化学

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-04-20 15:58:54

跑一圈SANDER是什么意思呢？用AMBER进行动力学模拟，查看结果直接看out文件就行，那里面应该有你想要的信息，比如这个动力学是否正常结束等。

努力的生活着

3楼2012-04-20 09:05:30

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