| 查看: 2091 | 回复: 5 | ||||
[求助]
三个原子之间的势能面扫描怎么做？
|
|
要做势能面扫描 同时扫描两个自由度，分别为A原子到B原子的距离，以及B原子到C原子的距离 用的是Z-matrix，柔性扫描我会做，但是刚性我就不会了。 1. geom=connectivity要写么？意即，原子连接信息该还是不该保留？ 2. 我看了高斯官网上scan怎么写，它直接用R1 A1什么的来表示键长或者键角 (http://www.gaussian.com/g_tech/g_ur/k_scan.htm)，内坐标有两种方式来写，一种是用A123 B125 D126这样的来替代具体数值，然后数值放在后面；一种就是把具体数值直接写出来。 问题我扫描的是A原子到B原子的距离，以及B原子到C原子的距离(意即让B原子慢慢远离A，同时慢慢接近C)，B和C之间本来就不成键的，这又要怎么写啊？ 另外，刚性扫描可不可以像柔性扫描那样，写两个原子的原子编号，然后是步长和每步距离？要是可以的话应该怎么写？写了以后加在哪里？ 谢谢各位指导！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 科研工具专辑 | Gaussian |
» 猜你喜欢
研究发现一个新的临界系数，独立于临界压缩因子
已经有7人回复
-
PbS量子点如何确定浓度
已经有11人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有176人回复
-
200年来人们一直无法破解的难题： 气液临界点状态方程
已经有7人回复
-
关于引力延迟下双星系统角动量不守恒的疑惑---求高手解答！
已经有10人回复
-
大湾区大学刘天辉课题组招收2026级博士生（与中山大学物理学院联合培养）
已经有22人回复
-
PbS量子点紫外吸收
已经有0人回复
-
比利时鲁汶大学与国家留学基金委共同资助博士研究生CSC-KU Leuven PhD Scholarship
已经有0人回复
-
七嗪类物质合成求助
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
【求教】电子密度，差分密度，原子电荷这三个之间有什么关系？
已经有7人回复- 势能面扫描出现错误，求帮助
已经有3人回复
- 怎么用gaussian计算计算双原子分子势能曲线？
已经有15人回复
- 我做opt=modredundant势能面扫描的时候总是报103错，哪位帮帮我啊？
已经有9人回复
- 关于势能面扫描！！
已经有11人回复
- 新手求助：gaussian03里怎么进行势能面扫描计算！
已经有10人回复
- 【求助】谁能帮我用Gaus03做一下丁二烯的势能面扫描
已经有25人回复
mchen10
金虫 (正式写手)
- 应助: 13 (小学生)
- 金币: 1508.2
- 散金: 41
- 红花: 6
- 帖子: 425
- 在线: 159.5小时
- 虫号: 695973
- 注册: 2009-02-04
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
minatomirai(金币+5): ★★★★★最佳答案 2012-03-01 00:35:23
minatomirai(金币+5): ★★★★★最佳答案 2012-03-01 00:35:23
|
直线的话两个变量 AB CB 非直线的话再加上 角度 ABC 是不是固定 B 原子会比较方便啊(建z-matrix的时候把B放第一个： B A 1 AB C 1 CB 2 ABC) 有没有geom=connectivity无所谓 用scan命令，在坐标后加上： AB 1.0 50 0.05 CB 3.5 50 -0.05 ABC 60.0 100 1.0 AB从1.0 angstrom扫到 3.5angstrom BC 从3.5扫到1.0 （其实正着扫倒着扫是一样的呵） ABC从60度扫到160度 |
2楼2012-02-29 04:23:47
astringent
铜虫 (著名写手)
- 应助: 16 (小学生)
- 金币: 2210.7
- 散金: 1233
- 红花: 4
- 帖子: 1180
- 在线: 354.8小时
- 虫号: 900839
- 注册: 2009-11-12
- 专业: 理论和计算化学
3楼2012-02-29 05:36:02
astringent
铜虫 (著名写手)
- 应助: 16 (小学生)
- 金币: 2210.7
- 散金: 1233
- 红花: 4
- 帖子: 1180
- 在线: 354.8小时
- 虫号: 900839
- 注册: 2009-11-12
- 专业: 理论和计算化学
4楼2012-02-29 05:38:24
lishijunzong
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 214 (大学生)
- 金币: 5034
- 红花: 10
- 帖子: 574
- 在线: 195.1小时
- 虫号: 1121020
- 注册: 2010-10-13
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
5楼2012-02-29 07:40:12
6楼2012-03-01 00:35:13