| 查看: 2363 | 回复: 5 | ||||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||||
[求助]
三个原子之间的势能面扫描怎么做？
|
||||
|
要做势能面扫描 同时扫描两个自由度，分别为A原子到B原子的距离，以及B原子到C原子的距离 用的是Z-matrix，柔性扫描我会做，但是刚性我就不会了。 1. geom=connectivity要写么？意即，原子连接信息该还是不该保留？ 2. 我看了高斯官网上scan怎么写，它直接用R1 A1什么的来表示键长或者键角 (http://www.gaussian.com/g_tech/g_ur/k_scan.htm)，内坐标有两种方式来写，一种是用A123 B125 D126这样的来替代具体数值，然后数值放在后面；一种就是把具体数值直接写出来。 问题我扫描的是A原子到B原子的距离，以及B原子到C原子的距离(意即让B原子慢慢远离A，同时慢慢接近C)，B和C之间本来就不成键的，这又要怎么写啊？ 另外，刚性扫描可不可以像柔性扫描那样，写两个原子的原子编号，然后是步长和每步距离？要是可以的话应该怎么写？写了以后加在哪里？ 谢谢各位指导！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 科研工具专辑 | Gaussian |
» 猜你喜欢
【211博士招生】环境化学、地学、毒理方向，擅长污染物迁移转化降解、计算模拟者优先
已经有17人回复
-
求助如何利用vasp计算磁光克尔效应
已经有1人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有98人回复
-
070300总分298求调剂
已经有2人回复
-
一志愿厦门大学化学学硕307求调剂
已经有19人回复
-
理论与计算化学方向调剂——初试388分（数学144）
已经有2人回复
-
调剂招生
已经有7人回复
-
河南理工大学化工学院招收调剂生啦！
已经有1人回复
-
硕士研究生调剂
已经有0人回复
-
投稿期刊求助
已经有1人回复
-
江西师大化学工程学院调剂今晚0点开放！ 缺额100个，速冲！
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 【求教】电子密度，差分密度，原子电荷这三个之间有什么关系？
已经有7人回复
- 势能面扫描出现错误，求帮助
已经有3人回复
- 怎么用gaussian计算计算双原子分子势能曲线？
已经有15人回复
- 我做opt=modredundant势能面扫描的时候总是报103错，哪位帮帮我啊？
已经有9人回复
- 关于势能面扫描！！
已经有11人回复
- 新手求助：gaussian03里怎么进行势能面扫描计算！
已经有10人回复
- 【求助】谁能帮我用Gaus03做一下丁二烯的势能面扫描
已经有25人回复
6楼2012-03-01 00:35:13
mchen10
金虫 (正式写手)
- 应助: 13 (小学生)
- 金币: 1508.2
- 散金: 41
- 红花: 6
- 帖子: 425
- 在线: 159.5小时
- 虫号: 695973
- 注册: 2009-02-04
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
minatomirai(金币+5): ★★★★★最佳答案 2012-03-01 00:35:23
minatomirai(金币+5): ★★★★★最佳答案 2012-03-01 00:35:23
|
直线的话两个变量 AB CB 非直线的话再加上 角度 ABC 是不是固定 B 原子会比较方便啊(建z-matrix的时候把B放第一个： B A 1 AB C 1 CB 2 ABC) 有没有geom=connectivity无所谓 用scan命令，在坐标后加上： AB 1.0 50 0.05 CB 3.5 50 -0.05 ABC 60.0 100 1.0 AB从1.0 angstrom扫到 3.5angstrom BC 从3.5扫到1.0 （其实正着扫倒着扫是一样的呵） ABC从60度扫到160度 |
2楼2012-02-29 04:23:47
astringent
铜虫 (著名写手)
- 应助: 16 (小学生)
- 金币: 2210.7
- 散金: 1233
- 红花: 4
- 帖子: 1180
- 在线: 354.8小时
- 虫号: 900839
- 注册: 2009-11-12
- 专业: 理论和计算化学
3楼2012-02-29 05:36:02
astringent
铜虫 (著名写手)
- 应助: 16 (小学生)
- 金币: 2210.7
- 散金: 1233
- 红花: 4
- 帖子: 1180
- 在线: 354.8小时
- 虫号: 900839
- 注册: 2009-11-12
- 专业: 理论和计算化学
4楼2012-02-29 05:38:24
10
