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关于在http://eztaxon-e.ezbiocloud.net/中通过比对获得16S rDNA同源序列问题 已有2人参与
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请韩国人的网站http://eztaxon-e.ezbiocloud.net中,怎样比对获得16S rDNA同源序列。本人正在做发育树，但不知道怎么去那个网站比对。我的16S rDNA序列是：CCCTGTCACTTAGGCGGCTGGCTCCAAAAGGTTACCCCACCGACTTCGGGTGTTACAAACTCTCGTGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGGGAACGTATTCACCGCGGCATGCTGATCCGCGATTACTAGCGATTCCAGCTTCATGTAGGCGAGTTGCAGCCTACAATCCGAACTGAGAACGGTTTTATGAGATTAGCTCCACCTCGCGGTCTTGCAGCTCTTTGTACCGTCCATTGTAGCACGTGTGTAGCCCAGGTCATAAGGGGCATGATGATTTGACGTCATCCCCACCTTCCTCCGGTTTGTCACCGGCAGTCACCTTAGAGTGCCCAACTTAATGATGGCAACTAAGATCAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATCTCACGACACGAGCTGACGACAACCATGCACCACCTGTCACTCTGCTCCCGAAGGAGAAGCCCTATCTCTAGGGTTGTCAGAGGATGTCAAGACCTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAGCCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGAGTGCTTAATGCGTTAACTTCAGCACTAAAGGGCGGAAACCCTCTAACACTTAGCACTCATCGTTTACGGCGTGGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAGTGTCAGTTACAGACCAGAAAGTCGCCTTCGCCACTGGTGTTCCTCCATATCTCTACGCATTTCACCGCTACACATGGAATTCCACTTTCCTCTTCTGCACTCAAGTCTCCCAGTTTCCAATGACCCTCCACGGTTGAGCCGTGGGCTTTCACATCAGACTTAAGAAACCACCTGCGCGCGCTTTACGCCCAATAATTCCGGATAACGCTTGCCACCTACGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGTAGTTAGCCGTGGCTTTCTGGTTAGGTACCGTCAAGGTGCCAGCTTATTCAACTAGCACTTGTTCTTCCCTAACAACAGAGTTTTACGACCCGAAAGCCTTCATCACTCACGCGGCGTTGCTCCGTCAGACTTTCGTCCATTGCGGAAGATTCCCTACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCTGGGCCGTGTCTCAGTCCCAGTGTGGCCGATCACCCTCTCAGGTCGGCTACGCATCGTTGCCTTGGTGAGCCGTTACCTCACCAACTAGCTAATGCGACGCGGGTCCATCCATAAGTGACAGCCGAAGCCGCCTTTCAATTTCGAACCATGCGGTTCAAAATGTTATCCGGTATTAGCCCCGGTTTCCCGGAGTTATCCCAGTCTTATGGGCAGGTTACCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACTTCATAAGAGCAAGCTCTTAATCCATTCGCTCGACTGCATGTATAGCACGCCGCAACGCCC 麻烦好心的朋友给予解答，或者帮我在http://eztaxon-e.ezbiocloud.net比对一下。多谢！！ |
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4楼2014-07-06 11:10:34
luckyjunjie
新虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 8.5
- 散金: 100
- 红花: 1
- 帖子: 38
- 在线: 34.6小时
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- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
2楼2012-04-14 22:34:13
痴客
木虫 (正式写手)
吃货250
- MicEPI: 1
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- 红花: 10
- 沙发: 2
- 帖子: 942
- 在线: 202小时
- 虫号: 1158985
- 注册: 2010-11-30
- 专业: 环境微生物学
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
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这是EzTaxon server 2.1的比对结果，与Bacillus anthracis ATCC 14578(T)的相似性为100%，也可能是Bacillus acidiceler CBD 119(T)的一个互补序列 Time (y-m-d h:m) Tasks Job Type Query Hit Accession Similarity 2012-4-15 0:55 Identify UserSeq Bacillus anthracis ATCC 14578(T) AB190217 100.000 2011-12-14 16:24 Identify UserSeq Marinobacter algicola DG893(T) ABCP01000031 99.533 2011-12-14 14:20 Identify UserSeq Bacillus nanhaiensis JSM 082006(T) GU477780 99.790 2011-12-14 14:5 Identify UserSeq Bacillus nanhaiensis JSM 082006(T) GU477780 99.790 2011-12-14 11:33 Identify UserSeq Idiomarina zobellii KMM 231(T) AF052741 98.974 2011-12-14 10:13 Identify UserSeq Sulfitobacter pontiacus DSM 10014(T) Y13155 99.785 2011-12-14 10:10 Identify UserSeq Phaeobacter caeruleus CCUG 55859(T) AM943630 99.857 2011-12-13 20:57 Identify UserSeq Halomonas shengliensis SL014B-85(T) EF121853 99.384 |
3楼2012-04-15 00:11:51
5楼2014-07-06 11:11:47
