| 查看: 3876 | 回复: 6 | |||
[求助]
关于在http://eztaxon-e.ezbiocloud.net/中通过比对获得16S rDNA同源序列问题 已有2人参与
|
|
请韩国人的网站http://eztaxon-e.ezbiocloud.net中,怎样比对获得16S rDNA同源序列。本人正在做发育树，但不知道怎么去那个网站比对。我的16S rDNA序列是：CCCTGTCACTTAGGCGGCTGGCTCCAAAAGGTTACCCCACCGACTTCGGGTGTTACAAACTCTCGTGGTGTGACGGGCGGTGTGTACAAGGCCCGGGAACGTATTCACCGCGGCATGCTGATCCGCGATTACTAGCGATTCCAGCTTCATGTAGGCGAGTTGCAGCCTACAATCCGAACTGAGAACGGTTTTATGAGATTAGCTCCACCTCGCGGTCTTGCAGCTCTTTGTACCGTCCATTGTAGCACGTGTGTAGCCCAGGTCATAAGGGGCATGATGATTTGACGTCATCCCCACCTTCCTCCGGTTTGTCACCGGCAGTCACCTTAGAGTGCCCAACTTAATGATGGCAACTAAGATCAAGGGTTGCGCTCGTTGCGGGACTTAACCCAACATCTCACGACACGAGCTGACGACAACCATGCACCACCTGTCACTCTGCTCCCGAAGGAGAAGCCCTATCTCTAGGGTTGTCAGAGGATGTCAAGACCTGGTAAGGTTCTTCGCGTTGCTTCGAATTAAACCACATGCTCCACCGCTTGTGCGGGCCCCCGTCAATTCCTTTGAGTTTCAGCCTTGCGGCCGTACTCCCCAGGCGGAGTGCTTAATGCGTTAACTTCAGCACTAAAGGGCGGAAACCCTCTAACACTTAGCACTCATCGTTTACGGCGTGGACTACCAGGGTATCTAATCCTGTTTGCTCCCCACGCTTTCGCGCCTCAGTGTCAGTTACAGACCAGAAAGTCGCCTTCGCCACTGGTGTTCCTCCATATCTCTACGCATTTCACCGCTACACATGGAATTCCACTTTCCTCTTCTGCACTCAAGTCTCCCAGTTTCCAATGACCCTCCACGGTTGAGCCGTGGGCTTTCACATCAGACTTAAGAAACCACCTGCGCGCGCTTTACGCCCAATAATTCCGGATAACGCTTGCCACCTACGTATTACCGCGGCTGCTGGCACGTAGTTAGCCGTGGCTTTCTGGTTAGGTACCGTCAAGGTGCCAGCTTATTCAACTAGCACTTGTTCTTCCCTAACAACAGAGTTTTACGACCCGAAAGCCTTCATCACTCACGCGGCGTTGCTCCGTCAGACTTTCGTCCATTGCGGAAGATTCCCTACTGCTGCCTCCCGTAGGAGTCTGGGCCGTGTCTCAGTCCCAGTGTGGCCGATCACCCTCTCAGGTCGGCTACGCATCGTTGCCTTGGTGAGCCGTTACCTCACCAACTAGCTAATGCGACGCGGGTCCATCCATAAGTGACAGCCGAAGCCGCCTTTCAATTTCGAACCATGCGGTTCAAAATGTTATCCGGTATTAGCCCCGGTTTCCCGGAGTTATCCCAGTCTTATGGGCAGGTTACCCACGTGTTACTCACCCGTCCGCCGCTAACTTCATAAGAGCAAGCTCTTAATCCATTCGCTCGACTGCATGTATAGCACGCCGCAACGCCC 麻烦好心的朋友给予解答，或者帮我在http://eztaxon-e.ezbiocloud.net比对一下。多谢！！ |
回复此楼» 猜你喜欢
欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律
已经有81人回复
-
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有7人回复
-
感觉是下周放榜了
已经有7人回复
-
时间戳变了，能看出什么问题？
已经有4人回复
-
哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？
已经有15人回复
-
filecode=后面第一个是大写字母
已经有9人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有6人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
今天系统多次维护，明天很可能放榜！
已经有9人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 如果申请去英国读博，没有语言成绩，只有外方的语言水平证明，能通过CSC吗？
已经有34人回复
- 求助，如何能够获得县域的逐月的降雨数据。望请各位指条明路
已经有22人回复
- 收到lab on a chip的拒信，可否重投
已经有14人回复
- 澳大利亚访问学者需要有与外方合作者有合作项目才能获得担保信？
已经有7人回复
- 16S rRNA文库 引物的选择
已经有7人回复
- 高氏一号分离的菌用16S通用引物扩增不出条带
已经有9人回复
- 核磁碳信号显示只有一个碳，但实际与文献比对，应该是两个碳信号，怎么处理呢？
已经有13人回复
- 【分享】A First Course on Numerical Methods 【已搜索无重复】
已经有4人回复
- 关于筛选和鉴定细菌(16S rRNA)
已经有35人回复
- 菌株16S rDNA同源性分析方法！！
已经有5人回复
- 求助设计好的引物怎样通过blast比对来确定引物的正确性
已经有4人回复
- 讨论自然科学基金通过计算机软件对申请书内容进行比对的好处
已经有15人回复
- 【求助/交流】真菌28s RNA同源比对
已经有5人回复
luckyjunjie
新虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 8.5
- 散金: 100
- 红花: 1
- 帖子: 38
- 在线: 34.6小时
- 虫号: 1283029
- 注册: 2011-05-01
- 性别: GG
- 专业: 微生物资源与分类学
2楼2012-04-14 22:34:13
痴客
木虫 (正式写手)
吃货250
- MicEPI: 1
- 应助: 59 (初中生)
- 金币: 2534.4
- 散金: 23
- 红花: 10
- 沙发: 2
- 帖子: 942
- 在线: 202小时
- 虫号: 1158985
- 注册: 2010-11-30
- 专业: 环境微生物学
【答案】应助回帖
感谢参与，应助指数 +1
|
这是EzTaxon server 2.1的比对结果，与Bacillus anthracis ATCC 14578(T)的相似性为100%，也可能是Bacillus acidiceler CBD 119(T)的一个互补序列 Time (y-m-d h:m) Tasks Job Type Query Hit Accession Similarity 2012-4-15 0:55 Identify UserSeq Bacillus anthracis ATCC 14578(T) AB190217 100.000 2011-12-14 16:24 Identify UserSeq Marinobacter algicola DG893(T) ABCP01000031 99.533 2011-12-14 14:20 Identify UserSeq Bacillus nanhaiensis JSM 082006(T) GU477780 99.790 2011-12-14 14:5 Identify UserSeq Bacillus nanhaiensis JSM 082006(T) GU477780 99.790 2011-12-14 11:33 Identify UserSeq Idiomarina zobellii KMM 231(T) AF052741 98.974 2011-12-14 10:13 Identify UserSeq Sulfitobacter pontiacus DSM 10014(T) Y13155 99.785 2011-12-14 10:10 Identify UserSeq Phaeobacter caeruleus CCUG 55859(T) AM943630 99.857 2011-12-13 20:57 Identify UserSeq Halomonas shengliensis SL014B-85(T) EF121853 99.384 |
3楼2012-04-15 00:11:51
4楼2014-07-06 11:10:34
5楼2014-07-06 11:11:47
dllchina
木虫 (著名写手)
有机的微生物大神
- MicEPI: 8
- 应助: 350 (大学生)
- 贵宾: 0.047
- 金币: 3202.9
- 散金: 1849
- 红花: 88
- 沙发: 2
- 帖子: 1599
- 在线: 233.4小时
- 虫号: 953932
- 注册: 2010-02-08
- 性别: GG
- 专业: 生物物理、生物化学与分子
6楼2014-07-07 00:10:56
7楼2015-12-22 13:59:21
