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汕头大学海洋科学接受调剂
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caijj09

木虫 (职业作家)

[求助] MS 用Dmol3时出现问题,求高手解答

再用MS 的Dmol3进行优化时,发现原子溢出,如图二所示(原始晶胞如图一所示),这是什么情况造成的?看了下outmol文件,发现有以下几个warning:

第一条:Warning: negative hessian eigenvalues    1 -0.00310819  1.38800247

第二条:Warning: center of gravity displacement      0.0000000      0.0000000      0.0000338


请问这个时候该怎么处理?

图一  原始晶胞



图二 优化后溢出的情况
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自强不息
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caijj09

木虫 (职业作家)

引用回帖:
5楼: Originally posted by zzy870720z at 2012-04-13 10:13:29:
那应该没有问题吧,我以前这么搞都可以回来的

难道是人品问题?  好吧,我再试试。
自强不息
6楼2012-04-13 11:10:03
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zzy870720z

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-13 09:16:49
caijj09: 金币+5, ★★★很有帮助, 我重建了还是会这样,重复三次都是这种情况 2012-04-13 09:35:25
rebulid一下晶格应该就可以了吧,显示问题
博学、审问、慎思、明辨、笃学
2楼2012-04-13 09:09:25
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zzy870720z

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zh1987hs: 金币+2, 鼓励交流 2012-04-13 10:16:48
caijj09: 金币+10, ★★★很有帮助, 非常感谢区长热心帮忙 2012-04-13 11:10:56
不会吧,rebulid应该不会还出现上面的情况,你把rebulid过程说一下
博学、审问、慎思、明辨、笃学
3楼2012-04-13 09:48:12
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caijj09

木虫 (职业作家)

★ ★
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-04-13 10:36:57
引用回帖:
3楼: Originally posted by zzy870720z at 2012-04-13 09:48:12:
不会吧,rebulid应该不会还出现上面的情况,你把rebulid过程说一下

按照以下路径进行操作

Build | Crystals | Rebuild Crystal。。。。
自强不息
4楼2012-04-13 10:10:22
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