| 查看: 1472 | 回复: 10 | ||
[求助]
MS 用Dmol3时出现问题，求高手解答
|
|
再用MS 的Dmol3进行优化时，发现原子溢出，如图二所示（原始晶胞如图一所示），这是什么情况造成的？看了下outmol文件，发现有以下几个warning: 第一条：Warning: negative hessian eigenvalues 1 -0.00310819 1.38800247 第二条：Warning: center of gravity displacement 0.0000000 0.0000000 0.0000338 请问这个时候该怎么处理？  图一 原始晶胞  图二 优化后溢出的情况 |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急
已经有6人回复
-
明天应该可查了！？
已经有5人回复
-
如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》
已经有7人回复
-
没有任何消息-是不是就凉了
已经有8人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
人气不行了
已经有10人回复
-
我面上完蛋了
已经有10人回复
-
能否退出参与的面上项目解除限项
已经有24人回复
-
filecode，4个jtjc了
已经有17人回复
-
2026国自然函评费到账
已经有19人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求问我这样用DMOL3算吸附过程对不对
已经有7人回复
- MS之DMOL3中的任务排队问题？求解...
已经有6人回复
- DMol3 Calculation遇到的初级问题，求解答
已经有7人回复
- 【500金币本版活动】“经验力场分子模拟+第一性原理计算问题讨论互助及资源共享”
已经有82人回复
- 【求助】Dmol3出错
已经有3人回复
- 【求助】MS5.0中Dmol3计算频率问题
已经有21人回复
- 【求助】请高手帮忙看看，派送大红包。dmol3 模块
已经有18人回复
- 【求助】50金币求助，金属间界面和金属氧化物间界面模型怎么建立？
已经有30人回复
- 【求助】ms提交到服务器计算时，显示running但没有实质计算
已经有12人回复
zzy870720z
荣誉版主 (文坛精英)
- 应助: 47 (小学生)
- 贵宾: 9.05
- 金币: 30914.3
- 散金: 5613
- 红花: 68
- 沙发: 99
- 帖子: 12592
- 在线: 23567.6小时
- 虫号: 745488
- 注册: 2009-04-10
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
- 管辖: 分子模拟
2楼2012-04-13 09:09:25
zzy870720z
荣誉版主 (文坛精英)
- 应助: 47 (小学生)
- 贵宾: 9.05
- 金币: 30914.3
- 散金: 5613
- 红花: 68
- 沙发: 99
- 帖子: 12592
- 在线: 23567.6小时
- 虫号: 745488
- 注册: 2009-04-10
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
- 管辖: 分子模拟
3楼2012-04-13 09:48:12
4楼2012-04-13 10:10:22
zzy870720z
荣誉版主 (文坛精英)
- 应助: 47 (小学生)
- 贵宾: 9.05
- 金币: 30914.3
- 散金: 5613
- 红花: 68
- 沙发: 99
- 帖子: 12592
- 在线: 23567.6小时
- 虫号: 745488
- 注册: 2009-04-10
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
- 管辖: 分子模拟
5楼2012-04-13 10:13:29
难道是人品问题？ 好吧，我再试试。 6楼2012-04-13 11:10:03
安德
铁杆木虫 (著名写手)
** *_** ___ ***_ * _*
- 应助: 69 (初中生)
- 金币: 7097.5
- 散金: 472
- 红花: 5
- 帖子: 1271
- 在线: 846.4小时
- 虫号: 818168
- 注册: 2009-07-29
- 性别: GG
- 专业: 星系和类星体
7楼2012-04-13 12:17:38
|
input文件如下： # Task parameters Calculate optimize Opt_energy_convergence 2.0000e-005 Opt_gradient_convergence 4.0000e-003 A Opt_displacement_convergence 5.0000e-003 A Opt_iterations 50 Opt_max_displacement 0.3000 A Lattice_optimization on Simple_geometry_opt Symmetry on Max_memory 2048 # Electronic parameters Spin_polarization restricted Charge 0 Basis dnd Pseudopotential none Functional pwc Harris off Aux_density octupole Integration_grid medium Occupation fermi Cutoff_Global 4.3000 angstrom Scf_density_convergence 1.0000e-005 Scf_charge_mixing 0.2000 Scf_iterations 50 Scf_diis 6 pulay # Kpoint definition file (intervals/offset): Kpoints file 2 4 2 0.0000 0.0000 0.0000 Sn3O_OH_2SO4.kpoints # Calculated properties |
8楼2012-04-13 14:15:42
安德
铁杆木虫 (著名写手)
** *_** ___ ***_ * _*
- 应助: 69 (初中生)
- 金币: 7097.5
- 散金: 472
- 红花: 5
- 帖子: 1271
- 在线: 846.4小时
- 虫号: 818168
- 注册: 2009-07-29
- 性别: GG
- 专业: 星系和类星体
9楼2012-04-13 16:24:46
10楼2012-04-13 17:33:01
