| 查看: 1201 | 回复: 3 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
vasp在集群上进行截断能测试时如何写输入文件
|
||
|
本人 vasp的新手。在集群上想对Al-fcc 进行一下截断能测试。我再网上搜了其他人的做法，在提交任务时提交了四个文件POSCAR,POTCAR.KPOINTS和run_e这四个文件。另外还有一个运行VASP的脚本文件。把run_e文件的权限也改了，但是运行一直会出现同样的错误，out.log文件如下： Error reading item 'IMAGES' from file INCAR. Error reading item 'IMAGES' from file INCAR. Error reading item 'IMAGES' from file INCAR. Error reading item 'IMAGES' from file INCAR. Error reading item 'IMAGES' from file INCAR. Error reading item 'IMAGES' from file INCAR. Job /lsf1/8.0/linux2.6-glibc2.3-x86_64/bin/openmpi_wrapper /share/home/sci_028/sourcecode/vasp.5.2/vasp TID HOST_NAME COMMAND_LINE STATUS TERMINATION_TIME ===== ========== ================ ======================= =================== 00000 blade086 /share/home/sci_ Done 04/09/2012 10:55:18 00001 blade086 /share/home/sci_ Done 04/09/2012 10:55:18 00002 blade086 /share/home/sci_ Done 04/09/2012 10:55:18 00003 blade086 /share/home/sci_ Done 04/09/2012 10:55:18 00004 blade086 /share/home/sci_ Done 04/09/2012 10:55:18 00005 blade086 /share/home/sci_ Done 04/09/2012 10:55:18 不知道是怎么回事，恳请高手指教。谢谢了。下面是我的run_e文件。 #!/bin/sh rm WAVECAR for i in 250 300 350 400 450 500 do cat > INCAR < SYSTEM = Al-fcc ENCUT = $i ISTART = 0 ; ICHARG = 2 ISMEAR = -5 PREC = Accurate ! echo "ENCUT = $i ev" ; time vasp E=`grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f\n",$5}'` echo $i $E >> comment done 我在提交时到底应该输入几个文件？ |
回复此楼» 猜你喜欢
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
vasp并行测试时出错。
已经有7人回复
- 【活动】Show 脚本，赢奖励
已经有23人回复
- VASP 5.2 集群编译错误 undefined reference to `MAIN__'
已经有8人回复
- Vasp中删除一个键 输入文件如何表现出来？
已经有8人回复
- 【求助成功】vasp测试K点收敛性的脚本问题
已经有20人回复
- 【求助】vasp中COOP如何理解及输出文件如何处理？
已经有12人回复
- 【求助完毕】集群上用vasp计算ELF有ELFCAR而没有DOSCAR是啥问题？
已经有15人回复
- 【求助】vasp做优化和静态计算的截断能一样吗？
已经有4人回复
- 【求助】vasp截断能不收敛
已经有7人回复
- 【求助】求VASP计算ZnO能带和态密度的详细输入设置
已经有15人回复
- 【求助】vasp在集群上如何安装
已经有3人回复
gowoaini131
新虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 3761.8
- 帖子: 54
- 在线: 115.5小时
- 虫号: 4193597
- 注册: 2015-11-03
- 专业: 样品前处理方法与技术
4楼2016-01-10 23:55:06
likai0106
金虫 (小有名气)
- 1ST强帖: 2
- 应助: 38 (小学生)
- 金币: 1352.4
- 帖子: 233
- 在线: 68.5小时
- 虫号: 634278
- 注册: 2008-10-23
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性 II ：电子结构
2楼2012-04-10 07:54:53
3楼2012-04-11 09:36:13
5