24小时热门版块排行榜    

查看: 1381  |  回复: 3

lirui1029

新虫 (初入文坛)

[求助] vasp在集群上进行截断能测试时如何写输入文件

本人 vasp的新手。在集群上想对Al-fcc 进行一下截断能测试。我再网上搜了其他人的做法,在提交任务时提交了四个文件POSCAR,POTCAR.KPOINTS和run_e这四个文件。另外还有一个运行VASP的脚本文件。把run_e文件的权限也改了,但是运行一直会出现同样的错误,out.log文件如下:
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Job  /lsf1/8.0/linux2.6-glibc2.3-x86_64/bin/openmpi_wrapper /share/home/sci_028/sourcecode/vasp.5.2/vasp

TID   HOST_NAME   COMMAND_LINE            STATUS            TERMINATION_TIME
===== ========== ================  =======================  ===================
00000 blade086   /share/home/sci_  Done                     04/09/2012 10:55:18
00001 blade086   /share/home/sci_  Done                     04/09/2012 10:55:18
00002 blade086   /share/home/sci_  Done                     04/09/2012 10:55:18
00003 blade086   /share/home/sci_  Done                     04/09/2012 10:55:18
00004 blade086   /share/home/sci_  Done                     04/09/2012 10:55:18
00005 blade086   /share/home/sci_  Done                     04/09/2012 10:55:18

不知道是怎么回事,恳请高手指教。谢谢了。下面是我的run_e文件。
#!/bin/sh
rm WAVECAR
for i in 250 300 350 400 450 500
do
cat > INCAR < SYSTEM = Al-fcc
ENCUT = $i
ISTART = 0 ; ICHARG = 2
ISMEAR = -5
PREC = Accurate
!
echo "ENCUT = $i ev" ; time vasp
E=`grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f\n",$5}'`
echo $i $E >> comment
done
我在提交时到底应该输入几个文件?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

likai0106

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
WDD880227: 金币+1, 多谢您的耐心帮助~~ 2012-04-10 08:36:46
你不要运行vasp这个脚本是生成不同的INCAR,也就是说你的run_e这个脚本中集成了vasp的命令。你的run_e应该是绿色的就是run_e.sh这种。你运行的时候直接输入./run_e,如果这样不行,你把他更名为run_e.sh,之后运行sh run_e.sh,还有在time vasp这行一定要改成你集群的路径,要不是识别不出vasp的。
2楼2012-04-10 07:54:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lirui1029

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by likai0106 at 2012-04-10 07:54:53:
你不要运行vasp这个脚本是生成不同的INCAR,也就是说你的run_e这个脚本中集成了vasp的命令。你的run_e应该是绿色的就是run_e.sh这种。你运行的时候直接输入./run_e,如果这样不行,你把他更名为run_e.sh,之后运行 ...

谢谢。我测试成功了。呵呵
3楼2012-04-11 09:36:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gowoaini131

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lirui1029 at 2012-04-11 09:36:13
谢谢。我测试成功了。呵呵...

截断能测试需要哪几个文件啊?求指教

发自小木虫Android客户端
4楼2016-01-10 23:55:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lirui1029 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-30 06:55 by ZPa0EcMwuECS
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 7/350 2026-08-30 06:43 by ZPa0EcMwuECS
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 8/400 2026-08-30 05:51 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-30 05:48 by winsaint
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 13/650 2026-08-30 05:38 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 3/150 2026-08-30 02:33 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 6/300 2026-08-30 01:58 by ZPa0EcMwuECS
[考博] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-30 01:34 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 6/300 2026-08-30 01:25 by ZPa0EcMwuECS
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-30 01:03 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +5 德尚中行 2026-08-27 6/300 2026-08-29 18:10 by manplx
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +4 tannykie 2026-08-29 4/200 2026-08-29 17:14 by lmz0216
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
请填处理意见