24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1209  |  回复: 3

lirui1029

新虫 (初入文坛)

[求助] vasp在集群上进行截断能测试时如何写输入文件

本人 vasp的新手。在集群上想对Al-fcc 进行一下截断能测试。我再网上搜了其他人的做法,在提交任务时提交了四个文件POSCAR,POTCAR.KPOINTS和run_e这四个文件。另外还有一个运行VASP的脚本文件。把run_e文件的权限也改了,但是运行一直会出现同样的错误,out.log文件如下:
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
Job  /lsf1/8.0/linux2.6-glibc2.3-x86_64/bin/openmpi_wrapper /share/home/sci_028/sourcecode/vasp.5.2/vasp

TID   HOST_NAME   COMMAND_LINE            STATUS            TERMINATION_TIME
===== ========== ================  =======================  ===================
00000 blade086   /share/home/sci_  Done                     04/09/2012 10:55:18
00001 blade086   /share/home/sci_  Done                     04/09/2012 10:55:18
00002 blade086   /share/home/sci_  Done                     04/09/2012 10:55:18
00003 blade086   /share/home/sci_  Done                     04/09/2012 10:55:18
00004 blade086   /share/home/sci_  Done                     04/09/2012 10:55:18
00005 blade086   /share/home/sci_  Done                     04/09/2012 10:55:18

不知道是怎么回事,恳请高手指教。谢谢了。下面是我的run_e文件。
#!/bin/sh
rm WAVECAR
for i in 250 300 350 400 450 500
do
cat > INCAR < SYSTEM = Al-fcc
ENCUT = $i
ISTART = 0 ; ICHARG = 2
ISMEAR = -5
PREC = Accurate
!
echo "ENCUT = $i ev" ; time vasp
E=`grep "TOTEN" OUTCAR | tail -1 | awk '{printf "%12.6f\n",$5}'`
echo $i $E >> comment
done
我在提交时到底应该输入几个文件?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

likai0106

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
WDD880227: 金币+1, 多谢您的耐心帮助~~ 2012-04-10 08:36:46
你不要运行vasp这个脚本是生成不同的INCAR,也就是说你的run_e这个脚本中集成了vasp的命令。你的run_e应该是绿色的就是run_e.sh这种。你运行的时候直接输入./run_e,如果这样不行,你把他更名为run_e.sh,之后运行sh run_e.sh,还有在time vasp这行一定要改成你集群的路径,要不是识别不出vasp的。
2楼2012-04-10 07:54:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lirui1029

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by likai0106 at 2012-04-10 07:54:53:
你不要运行vasp这个脚本是生成不同的INCAR,也就是说你的run_e这个脚本中集成了vasp的命令。你的run_e应该是绿色的就是run_e.sh这种。你运行的时候直接输入./run_e,如果这样不行,你把他更名为run_e.sh,之后运行 ...

谢谢。我测试成功了。呵呵
3楼2012-04-11 09:36:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gowoaini131

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lirui1029 at 2012-04-11 09:36:13
谢谢。我测试成功了。呵呵...

截断能测试需要哪几个文件啊?求指教

发自小木虫Android客户端
4楼2016-01-10 23:55:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lirui1029 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求调剂一志愿武汉理工大学材料工程(085601) +6 WW.' 2026-03-23 8/400 2026-03-29 09:41 by lbsjt
[考研] 0703 化学 求调剂,一志愿山东大学 342 分 +4 Shern—- 2026-03-28 4/200 2026-03-29 00:47 by 544594351
[考研] 320分,材料与化工专业,求调剂 +9 一定上岸aaa 2026-03-27 13/650 2026-03-28 15:00 by 神马都不懂
[考研] 346求调剂 一志愿070303有机化学 +3 萝卜炖青菜 2026-03-28 3/150 2026-03-28 14:11 by 唐沐儿
[考研] 317求调剂 +6 十闲wx 2026-03-24 6/300 2026-03-28 13:27 by Iveryant
[考研] 一志愿南昌大学324求调剂 +7 hanamiko 2026-03-27 7/350 2026-03-28 09:56 by 李上岸0921
[考研] 张芳铭-中国农业大学-环境工程专硕-298 +4 手机用户 2026-03-26 4/200 2026-03-28 07:17 by mmm just
[考研] 328求调剂 +7 嗯滴的基本都 2026-03-27 7/350 2026-03-28 04:19 by fmesaito
[考研] 291求调剂 +7 孅華 2026-03-22 7/350 2026-03-28 04:02 by fmesaito
[考研] 330一志愿中国海洋大学 化学工程 085602 有读博意愿 求调剂 +3 wywy.. 2026-03-27 4/200 2026-03-28 03:32 by fmesaito
[考研] 材料与化工085600,总分304,本科有两篇sci参与,求调剂 +10 幸运的酱酱 2026-03-22 12/600 2026-03-27 16:08 by muchong357
[考研] 283求调剂(080500) +4 A child 2026-03-27 4/200 2026-03-27 15:34 by XPU李庆
[考研] 085600,材料与化工321分,求调剂 +9 大馋小子 2026-03-27 9/450 2026-03-27 14:30 by mmm just
[考研] 一志愿211,335分,0856,求调剂院校和导师 +4 倾____萧 2026-03-27 5/250 2026-03-27 11:52 by zhshch
[考研] 333求调剂 +3 question挽风 2026-03-23 3/150 2026-03-27 11:29 by 不吃魚的貓
[考研] 312求调剂 +9 上岸吧ZJY 2026-03-22 13/650 2026-03-27 11:24 by sanrepian
[考研] 325求调剂 +5 李嘉图·S·路 2026-03-23 5/250 2026-03-27 00:42 by wxiongid
[考研] 321求调剂 +6 wasdssaa 2026-03-26 6/300 2026-03-26 20:57 by sanrepian
[考研] 生物技术与工程 +3 1294608413 2026-03-25 4/200 2026-03-25 18:02 by 1294608413
[考研] 一志愿河北工业大学0817化工278分求调剂 +7 jhybd 2026-03-23 12/600 2026-03-24 09:03 by jhybd
信息提示
请填处理意见