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古木天恕木虫 (正式写手)
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进化树N-J法模型选择
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| 求助!大家进化树都用的什么模型?做出来的差别大吗? |
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molecula
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【答案】应助回帖
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古木天恕: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2012-04-09 14:01:44
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古木天恕: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2012-04-09 14:01:44
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一般来说 进化树都是用NJ模型 做出来的差别大不大不跟模型相关,跟你在GenBank筛选用来做进化树的基因序列的亲缘性远近有关。 这个东西一句两句说不清楚,给你举个例子吧: A跟B是亲戚,直系; A跟C是旁亲,A跟D是路人,A是黄种人,E是白人,F是黑人。 好了,选取这几个标本用来做进化树,做出来梯度是非常分明的,一般没什么问题,可信度也不错。 如果你选择的是A跟M是直系,A跟N是直系,A跟O是直系,A跟P是直系。 这几个做,做出来非常难看。生物信息学的东西,你去看看,有用。 加我好友吧,我分享给你一个生物信息学进化树制作专题。 这个是我的老师做的课件PPT,你不要外传。 |
2楼2012-04-08 23:59:48
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3楼2012-04-09 00:00:34
molecula
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4楼2012-04-09 00:00:55
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ahau11720397
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6楼2013-04-26 14:30:36
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7楼2015-10-30 23:05:12
dangtongzhou
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