24小时热门版块排行榜    

查看: 1830  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

古木天恕

木虫 (正式写手)

[求助] 进化树N-J法模型选择

求助!大家进化树都用的什么模型?做出来的差别大吗?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

futuregarden

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by molecula at 2012-04-08 23:59:48
一般来说 进化树都是用NJ模型
做出来的差别大不大不跟模型相关,跟你在GenBank筛选用来做进化树的基因序列的亲缘性远近有关。
这个东西一句两句说不清楚,给你举个例子吧:
A跟B是亲戚,直系;
A跟C是旁亲,A跟 ...

求PPT,谢谢!futuregarden@163.com
9楼2015-11-02 21:33:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

molecula

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
古木天恕: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2012-04-09 14:01:44
一般来说 进化树都是用NJ模型
做出来的差别大不大不跟模型相关,跟你在GenBank筛选用来做进化树的基因序列的亲缘性远近有关。
这个东西一句两句说不清楚,给你举个例子吧:
A跟B是亲戚,直系;
A跟C是旁亲,A跟D是路人,A是黄种人,E是白人,F是黑人。
好了,选取这几个标本用来做进化树,做出来梯度是非常分明的,一般没什么问题,可信度也不错。
如果你选择的是A跟M是直系,A跟N是直系,A跟O是直系,A跟P是直系。
这几个做,做出来非常难看。生物信息学的东西,你去看看,有用。
加我好友吧,我分享给你一个生物信息学进化树制作专题。
这个是我的老师做的课件PPT,你不要外传。
2楼2012-04-08 23:59:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

molecula

铁杆木虫 (著名写手)

怎么没办法上传课件?
4楼2012-04-09 00:00:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

木子雪

新虫 (初入文坛)

楼主可以给那个PPt给我吗?我是菜鸟,老师要我做进化树,但我根本就不知道从何下手
5楼2013-01-19 23:25:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 293求调剂 +6 zjl的号 2026-03-16 10/500 2026-03-17 13:45 by houyaoxu
[考研] 302求调剂 +4 小贾同学123 2026-03-15 8/400 2026-03-17 10:33 by 小贾同学123
[考研] 材料专硕274一志愿陕西师范大学求调剂 +5 薛云鹏 2026-03-13 5/250 2026-03-17 10:15 by Sammy2
[论文投稿] 有没有大佬发小论文能带我个二作 +3 增锐漏人 2026-03-17 4/200 2026-03-17 09:26 by xs74101122
[考研] 274求调剂 +5 时间点 2026-03-13 5/250 2026-03-17 07:34 by 热情沙漠
[考研] 328求调剂,英语六级551,有科研经历 +3 生物工程调剂 2026-03-16 4/200 2026-03-16 20:13 by Wangjingyue
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
[考研] 0805,333求调剂 +3 112253525 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:42 by JourneyLucky
[考研] 341求调剂 +4 番茄头--- 2026-03-10 4/200 2026-03-13 23:12 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +5 是Lupa啊 2026-03-11 5/250 2026-03-13 22:13 by JourneyLucky
[考研] 336求调剂 +6 Iuruoh 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:06 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +9 ADT 2026-03-11 9/450 2026-03-13 21:55 by JourneyLucky
[考研] 281求调剂 +9 Koxui 2026-03-12 11/550 2026-03-13 20:50 by Koxui
[考研] 材料工程调剂 +4 咪咪空空 2026-03-11 4/200 2026-03-13 19:57 by JourneyLucky
[考研] 工科278分求调剂 +5 周慢热啊 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:49 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +7 ADT 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:17 by JourneyLucky
[考研] 化工学硕306求调剂 +9 42838695 2026-03-12 9/450 2026-03-13 10:16 by houyaoxu
[考博] 26读博 +4 Rui135246 2026-03-12 10/500 2026-03-13 07:15 by gaobiao
[考研] 333求调剂 +3 152697 2026-03-12 4/200 2026-03-13 07:08 by Iveryant
信息提示
请填处理意见