24小时热门版块排行榜    

查看: 1831  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

古木天恕

木虫 (正式写手)

[求助] 进化树N-J法模型选择

求助!大家进化树都用的什么模型?做出来的差别大吗?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

futuregarden

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by molecula at 2012-04-08 23:59:48
一般来说 进化树都是用NJ模型
做出来的差别大不大不跟模型相关,跟你在GenBank筛选用来做进化树的基因序列的亲缘性远近有关。
这个东西一句两句说不清楚,给你举个例子吧:
A跟B是亲戚,直系;
A跟C是旁亲,A跟 ...

求PPT,谢谢!futuregarden@163.com
9楼2015-11-02 21:33:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

molecula

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
古木天恕: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2012-04-09 14:01:44
一般来说 进化树都是用NJ模型
做出来的差别大不大不跟模型相关,跟你在GenBank筛选用来做进化树的基因序列的亲缘性远近有关。
这个东西一句两句说不清楚,给你举个例子吧:
A跟B是亲戚,直系;
A跟C是旁亲,A跟D是路人,A是黄种人,E是白人,F是黑人。
好了,选取这几个标本用来做进化树,做出来梯度是非常分明的,一般没什么问题,可信度也不错。
如果你选择的是A跟M是直系,A跟N是直系,A跟O是直系,A跟P是直系。
这几个做,做出来非常难看。生物信息学的东西,你去看看,有用。
加我好友吧,我分享给你一个生物信息学进化树制作专题。
这个是我的老师做的课件PPT,你不要外传。
2楼2012-04-08 23:59:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

molecula

铁杆木虫 (著名写手)

怎么没办法上传课件?
4楼2012-04-09 00:00:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

木子雪

新虫 (初入文坛)

楼主可以给那个PPt给我吗?我是菜鸟,老师要我做进化树,但我根本就不知道从何下手
5楼2013-01-19 23:25:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 070300化学319求调剂 +4 锦鲤0909 2026-03-17 4/200 2026-03-17 18:21 by 重科小霸王
[考研] 材料专硕306英一数二 +7 z1z2z3879 2026-03-16 9/450 2026-03-17 17:31 by ccjequ
[考研] 考研化学学硕调剂,一志愿985 +4 张vvvv 2026-03-15 6/300 2026-03-17 17:15 by ruiyingmiao
[考研] 303求调剂 +3 睿08 2026-03-17 3/150 2026-03-17 15:24 by 哦哦123
[考研] 304求调剂 +5 素年祭语 2026-03-15 5/250 2026-03-16 17:00 by 我的船我的海
[考研] 304求调剂 +4 ahbd 2026-03-14 4/200 2026-03-16 16:48 by 我的船我的海
[教师之家] 焦虑 +7 水冰月月野兔 2026-03-13 9/450 2026-03-16 10:00 by Quakerbird
[考研] 327求调剂 +6 拾光任染 2026-03-15 11/550 2026-03-15 22:47 by 拾光任染
[考研] 机械专硕调剂 +3 笨笨兔子 2026-03-12 3/150 2026-03-15 20:02 by 栗子粥?
[考研] 26考研一志愿中国石油大学(华东)305分求调剂 +3 嘉年新程 2026-03-15 3/150 2026-03-15 13:58 by 哈哈哈哈嘿嘿嘿
[考研] 297一志愿上交085600求调剂 +5 指尖八千里 2026-03-14 5/250 2026-03-14 17:26 by a不易
[考研] 255求调剂 +3 李嘉慧, 2026-03-12 4/200 2026-03-14 16:58 by 有只狸奴
[考研] 331求调剂(0703有机化学 +5 ZY-05 2026-03-13 6/300 2026-03-14 10:51 by Jy?
[考研] 330求调剂 +3 ?酱给调剂跪了 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:13 by JourneyLucky
[考研] 招收0805(材料)调剂 +3 18595523086 2026-03-13 3/150 2026-03-14 00:33 by 123%、
[考研] 337一志愿华南理工0805材料求调剂 +7 mysdl 2026-03-11 9/450 2026-03-13 22:43 by JourneyLucky
[考研] 工科278分求调剂 +5 周慢热啊 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:49 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +3 是Lupa啊 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:30 by 求调剂zz
[考研] 283求调剂,材料、化工皆可 +8 苏打水7777 2026-03-11 10/500 2026-03-13 09:06 by Linda Hu
[考博] 26读博 +4 Rui135246 2026-03-12 10/500 2026-03-13 07:15 by gaobiao
信息提示
请填处理意见