应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 对分子基团距离scan
51/1返回列表
查看: 557  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

luojin7653

银虫 (正式写手)

[求助] 对分子基团距离scan

除了对分子键长进行scan外，如何把键断开对独立的两个基团之间距离进行scan呢？
求助 谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
今晚打老虎
1楼 2012-04-03 10:59:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mchen10

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
luojin7653: 金币+4 2012-04-04 11:56:28
A     B                                 G  H
                        E     -----       F                I
C                                              J
          d                                           K

如图所示
z-matrix:
E
F 1 r(EF)
B 1 R(BE) 2 A(BEF)
A 1 R(AE) 2 A(AEF) 3 D(AEFB)
C ...
D ...
G 2 R(GF) 1 A(GFE) 3 D(GFEB)
H ...

其中 r, R是键长，A为键角， D为二面角
小写是变量，大写是常量

在gaussian里的具体操作 请参照说明
在molpro里面可以用循环语句做
赞一下 回复此楼
更痛苦的是梦没醒路已经不能走了
2楼2012-04-04 05:33:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luojin7653

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by mchen10 at 2012-04-04 05:33:24:
A     B                                 G  H
                        E     -----       F                I
C                                              J
          d                             ...

谢谢，如果这样做 两个分子都是刚性的 还可以自动优化构形吗?
赞一下 回复此楼
今晚打老虎
3楼2012-04-04 11:56:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mchen10

金虫 (正式写手)
用gaussian是刚性的

用molpro把常量换成变量 可以达到柔性的效果
赞一下 回复此楼
更痛苦的是梦没醒路已经不能走了
4楼2012-04-04 22:38:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ldzh0531

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by mchen10 at 2012-04-04 05:33:24:
A     B                                 G  H
                        E     -----       F                I
C                                              J
          d                             ...

问下二面角怎么scan？我试了下只是一个原子动，其他3个都不动。我想要的效果是好像单间旋转的那种。
赞一下 回复此楼
5楼2012-04-04 23:05:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 luojin7653 的主题更新
51/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0856材料与化工，270求调剂 +3 YXCT 2026-03-01 3/150 2026-03-01 19:51 by 无懈可击111
[考研] 高分子化学与物理调剂 +6 好好好1233 2026-02-28 12/600 2026-03-01 19:48 by 好好好1233
[考研] 265分求调剂不调专业和学校有行学上就 +5 礼堂丁真258 2026-02-28 7/350 2026-03-01 19:12 by Js512888
[考研] 272求调剂 +6 材紫有化 2026-02-28 6/300 2026-03-01 18:58 by 18137688336
[考研] 0857调剂 +3 一ll半 2026-02-28 3/150 2026-03-01 18:32 by 热情沙漠
[考研] 材料学调剂 +9 提神豆沙包 2026-02-28 11/550 2026-03-01 18:15 by ms629
[考研] 材料类求调剂 +10 wana_kiko 2026-02-28 11/550 2026-03-01 18:11 by 海嵙Y
[考研] 化工专硕348，一志愿985求调剂 +5 弗格个 2026-02-28 8/400 2026-03-01 17:25 by sunny81
[考研] 化工专硕342，一志愿大连理工大学，求调剂 +3 kyf化工 2026-02-28 4/200 2026-03-01 16:49 by yywzz
[考研] 304求调剂 +6 曼殊2266 2026-02-28 7/350 2026-03-01 15:14 by wjLi2017
[考研] 材料工程274求调剂 +3 Lilithan 2026-03-01 3/150 2026-03-01 14:58 by ms629
[考研] 303求调剂 +4 今夏不夏 2026-03-01 4/200 2026-03-01 14:46 by 嘟嘟小浣熊
[考研] 298求调剂 +9 人间唯你是清欢 2026-02-28 12/600 2026-03-01 14:23 by Ducount.Y
[考研] 材料284求调剂，一志愿郑州大学英一数二专硕 +10 想上岸的土拨鼠 2026-02-28 10/500 2026-03-01 14:12 by yc258
[考研] 302材料工程求调剂 +4 Doleres 2026-03-01 5/250 2026-03-01 11:52 by liqiongjy
[考研] 调剂 +3 简木ChuFront 2026-02-28 3/150 2026-03-01 11:46 by 王伟要上岸啊
[论文投稿] 求助coordination chemistry reviews 的写作模板 10+3 ljplijiapeng 2026-02-27 4/200 2026-03-01 09:07 by babero
[考研] 272求调剂 +4 田智友 2026-02-28 4/200 2026-03-01 06:43 by 刘兵
[考研] 307求调剂 +4 73372112 2026-02-28 6/300 2026-03-01 00:04 by ll247
[考研] 304求调剂 +3 52hz~~ 2026-02-28 5/250 2026-03-01 00:00 by 52hz~~
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭