应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 对分子基团距离scan
51/1返回列表
查看: 640  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

luojin7653

银虫 (正式写手)

[求助] 对分子基团距离scan

除了对分子键长进行scan外，如何把键断开对独立的两个基团之间距离进行scan呢？
求助 谢谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
今晚打老虎
1楼 2012-04-03 10:59:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ldzh0531

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by mchen10 at 2012-04-04 05:33:24:
A     B                                 G  H
                        E     -----       F                I
C                                              J
          d                             ...

问下二面角怎么scan？我试了下只是一个原子动，其他3个都不动。我想要的效果是好像单间旋转的那种。
赞一下 回复此楼
5楼2012-04-04 23:05:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

mchen10

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
luojin7653: 金币+4 2012-04-04 11:56:28
A     B                                 G  H
                        E     -----       F                I
C                                              J
          d                                           K

如图所示
z-matrix:
E
F 1 r(EF)
B 1 R(BE) 2 A(BEF)
A 1 R(AE) 2 A(AEF) 3 D(AEFB)
C ...
D ...
G 2 R(GF) 1 A(GFE) 3 D(GFEB)
H ...

其中 r, R是键长，A为键角， D为二面角
小写是变量，大写是常量

在gaussian里的具体操作 请参照说明
在molpro里面可以用循环语句做
赞一下 回复此楼
更痛苦的是梦没醒路已经不能走了
2楼2012-04-04 05:33:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luojin7653

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by mchen10 at 2012-04-04 05:33:24:
A     B                                 G  H
                        E     -----       F                I
C                                              J
          d                             ...

谢谢，如果这样做 两个分子都是刚性的 还可以自动优化构形吗?
赞一下 回复此楼
今晚打老虎
3楼2012-04-04 11:56:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mchen10

金虫 (正式写手)
用gaussian是刚性的

用molpro把常量换成变量 可以达到柔性的效果
赞一下 回复此楼
更痛苦的是梦没醒路已经不能走了
4楼2012-04-04 22:38:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +7 布布和一二 2026-08-10 9/450 2026-08-11 22:12 by 医学老男孩
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 yPv6ndDtiRxQ 2026-08-11 3/150 2026-08-11 21:09 by thgx1vqMqrLw
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 yPv6ndDtiRxQ 2026-08-11 4/200 2026-08-11 21:03 by thgx1vqMqrLw
[基金申请] 有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验） +3 majunge000 2026-08-11 4/200 2026-08-11 20:13 by lch2012
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 yPv6ndDtiRxQ 2026-08-10 8/400 2026-08-11 19:56 by thgx1vqMqrLw
[基金申请] 什么时候出结果，有咨询渠道？？？ +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[论文投稿] 职称评审，求友友推荐见刊最快的期刊 +3 工厂打螺丝 2026-08-08 3/150 2026-08-11 13:42 by 会议编辑
[基金申请] 听说今天filecode变了 +26 布布和一二 2026-08-06 49/2450 2026-08-11 13:18 by WH3796
[基金申请] FileCode能看出啥？ +7 要乐观耀哥 2026-08-10 17/850 2026-08-11 10:50 by 要乐观耀哥
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分？ +10 yufeiwaner 2026-08-09 11/550 2026-08-10 18:47 by yufeiwaner
[基金申请] 静等基金结果 +5 gjjjzhong 2026-08-10 16/800 2026-08-10 17:19 by Tide man
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制，评价高的钱多评价低的钱少，但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 固定端突然变了，今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 好消息？这个有何含义？？？ +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭