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小猫三两只

金虫 (正式写手)

[求助] 套叠PCR

我想把基因内部的一段序列突变掉,采用套叠PCR的方法,两段PCR回收的大小分别为1400bp和200bp左右,但将这两段回收产物混合后作模板进行套叠,却怎么也扩不出目的带,请问是什么原因啊?我是大概按照浓度比1:1混合的,并且也试过不同体积的混合,结果都是一样,片段在250bp稍往上一点
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hyacinth326

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西瓜: 金币+3, Good! 2012-03-29 17:39:09
西瓜: 回帖置顶 2012-03-29 17:49:49
小猫三两只: 金币+3, ★★★很有帮助, 这个方法我试试,谢谢 2012-03-30 16:03:36
首先,加入的模板量的比例应该是摩尔比为1:1,其次,可以先不加上下游引物而让这两个片段搭到一起的那段为彼此的引物进行10个循环的扩增,然后再加入上下游引物扩增20个循环,如果还没有p出来的话,可以在不加引物的那十个循环里采取两步pcr的方法,我刚做了over lap pcr,2000bp的片段跟1000bp的片段一起搭,就是通过两步pcr做出来的,三步法压根没戏。
14楼2012-03-29 11:53:40
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imyting

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+3, 鼓励发帖提供有帮助的信息! 2012-03-27 19:17:27
你说的应该是重叠延伸PCR吧,第二步PCR的确比较难P,原因也多种多样,我看你还是在退火温度上琢磨一下吧,试试梯度之类的……这个P不出来的具体原因实在是很难分析,原因太多。重叠部分过短,重叠部分有非特异性结合等等,爱莫能助!
悠哉游哉做实验,成兮败兮我随便
2楼2012-03-27 13:12:15
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小猫三两只

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by imyting at 2012-03-27 13:12:15:
你说的应该是重叠延伸PCR吧,第二步PCR的确比较难P,原因也多种多样,我看你还是在退火温度上琢磨一下吧,试试梯度之类的……这个P不出来的具体原因实在是很难分析,原因太多。重叠部分过短,重叠部分有非特异性结 ...

是一个基因内缺失一段,用的基因内引物就把缺失的那段跨过去,扩增出两段后,再用全长基因的上下游引物,PCR混合产物作模板扩增。梯度我也试过,没什么效果
3楼2012-03-27 15:50:13
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敏敏8305

铜虫 (初入文坛)

感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 应助指数-1, 希望以后不应助的话,不要点应助哦 2012-03-29 10:26:22
请问楼主是做关于噬菌体展示技术方面的吗?
My heart will go on!
4楼2012-03-27 18:10:25
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