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小白问题：吉布斯自由能和活化能
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请教各位一个小白问题： 通过Gaussian03计算出某一分子的不同构象，result中给出的是各个构象结构的能量（如其一为-1300.70562872 Hartree），那么其吉布斯自由能该如何计算呢？活化能呢？ 多谢各位！ |
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dreampattern
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4楼2012-03-21 07:39:30
zhangmt
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【答案】应助回帖
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result中给出的能量不是体系能量，是体系中电子的能量。。。 要做频率分析以后，根据当前的温度、压力，计算出分子的平动、转动、振动的能量，以及核斥能，得到总的热力学内能——需要经过零点能矫正，再加上PV项得到焓值，再通过统计力学计算出分子的平动熵、转动熵、振动熵，计算总的熵值，乘以温度后，用焓值减去此项，得到吉布斯自由能值。 虽然看起来复杂，但只要你优化以后用一个freq命令就都可以得到，gaussian直接给出你要的结果。 至于活化能，请明确指出你说的是阿累尼乌斯活化能还是活化吉布斯自由能还是活化焓，这几项都是能量，含义不同。如果要计算，需要你寻找合适的反应机理，寻找正确的过渡态才能得到。 |
2楼2012-03-20 21:22:38
3楼2012-03-20 22:26:41
zhangmt
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既然是free energy of activation那当然就是活化自由能，在恒温恒压条件下（多数都是这个条件）也就是吉布斯自由能，偶尔的恒温恒容条件下指亥姆霍兹自由能。这个活化自由能，是需要通过确认反应机理然后计算过渡态得出来的。当然，做实验通过测定不同温度下的反应速率常数再拟合也是可以得到的。而实验得到的是表观活化能，属于阿雷尼乌兹活化能，或者用eyning公式拟合，还可以得到活化焓、活化熵以及活化吉布斯自由能。 至于ABC体系对比，永远是能量最低的最稳定。。当然，如果是没有考虑溶剂条件那么计算的数据就不准确。偶极大的容易溶于极性溶剂，原本能量稍高的大偶极矩分子在极性溶液中可能自由能就变成最低的，那稳定性对比就改变了。 |
5楼2012-03-21 12:31:21
